Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Dcaf11Q91VU6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Dcaf11Q91VU6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Dcaf11Q91VU6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Dcaf11Q91VU6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Dcaf11Q91VU6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Dcaf11Q91VU6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Dcaf11Q91VU6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Dcaf11Q91VU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Dcaf11Q91VU6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Dcaf11Q91VU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Dcaf11Q91VU6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Dcaf11Q91VU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Dcaf11Q91VU6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Dcaf11Q91VU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Dcaf11Q91VU6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dcaf11Q91VU6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dcaf11Q91VU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dcaf11Q91VU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Dcaf11Q91VU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dcaf11Q91VU6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Dcaf11Q91VU6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Dcaf11Q91VU6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Dcaf11Q91VU6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Dcaf11Q91VU6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Dcaf11Q91VU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Dcaf11Q91VU6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Dcaf11Q91VU6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Dcaf11Q91VU6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Dcaf11Q91VU6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Dcaf11Q91VU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Dcaf11Q91VU6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Dcaf11Q91VU6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Dcaf11Q91VU6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Dcaf11Q91VU6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Dcaf11Q91VU6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Dcaf11Q91VU6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Dcaf11Q91VU6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Dcaf11Q91VU6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Dcaf11Q91VU6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Dcaf11Q91VU6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Dcaf11Q91VU6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Dcaf11Q91VU6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Dcaf11Q91VU6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Dcaf11Q91VU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Dcaf11Q91VU6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Dcaf11Q91VU6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Dcaf11Q91VU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Dcaf11Q91VU6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Dcaf11Q91VU6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Dcaf11Q91VU6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Dcaf11Q91VU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Dcaf11Q91VU6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Dcaf11Q91VU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Dcaf11Q91VU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Dcaf11Q91VU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Dcaf11Q91VU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Dcaf11Q91VU6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Dcaf11Q91VU6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Dcaf11Q91VU6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Dcaf11Q91VU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Dcaf11Q91VU6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Dcaf11Q91VU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Dcaf11Q91VU6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Dcaf11Q91VU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Dcaf11Q91VU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Dcaf11Q91VU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Dcaf11Q91VU6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Dcaf11Q91VU6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Dcaf11Q91VU6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Dcaf11Q91VU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Dcaf11Q91VU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Dcaf11Q91VU6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Dcaf11Q91VU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Dcaf11Q91VU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Dcaf11Q91VU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Dcaf11Q91VU6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Dcaf11Q91VU6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Dcaf11Q91VU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Dcaf11Q91VU6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Dcaf11Q91VU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Dcaf11Q91VU6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Dcaf11Q91VU6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Dcaf11Q91VU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms