Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NifkQ91VE6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NifkQ91VE6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NifkQ91VE6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NifkQ91VE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NifkQ91VE6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NifkQ91VE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NifkQ91VE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NifkQ91VE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NifkQ91VE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NifkQ91VE6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NifkQ91VE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NifkQ91VE6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NifkQ91VE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NifkQ91VE6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NifkQ91VE6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NifkQ91VE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NifkQ91VE6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NifkQ91VE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NifkQ91VE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NifkQ91VE6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NifkQ91VE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NifkQ91VE6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NifkQ91VE6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NifkQ91VE6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NifkQ91VE6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NifkQ91VE6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NifkQ91VE6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NifkQ91VE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NifkQ91VE6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NifkQ91VE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NifkQ91VE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NifkQ91VE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NifkQ91VE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NifkQ91VE6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NifkQ91VE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NifkQ91VE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NifkQ91VE6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NifkQ91VE6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NifkQ91VE6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NifkQ91VE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NifkQ91VE6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NifkQ91VE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NifkQ91VE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NifkQ91VE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NifkQ91VE6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NifkQ91VE6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NifkQ91VE6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NifkQ91VE6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NifkQ91VE6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NifkQ91VE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms