Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan10Q8VCF5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan10Q8VCF5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan10Q8VCF5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan10Q8VCF5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan10Q8VCF5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan10Q8VCF5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan10Q8VCF5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan10Q8VCF5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan10Q8VCF5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan10Q8VCF5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan10Q8VCF5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan10Q8VCF5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan10Q8VCF5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan10Q8VCF5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tspan10Q8VCF5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan10Q8VCF5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tspan10Q8VCF5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan10Q8VCF5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan10Q8VCF5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tspan10Q8VCF5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan10Q8VCF5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan10Q8VCF5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan10Q8VCF5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan10Q8VCF5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan10Q8VCF5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tspan10Q8VCF5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan10Q8VCF5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan10Q8VCF5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan10Q8VCF5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan10Q8VCF5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan10Q8VCF5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan10Q8VCF5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan10Q8VCF5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan10Q8VCF5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan10Q8VCF5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan10Q8VCF5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan10Q8VCF5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan10Q8VCF5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan10Q8VCF5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan10Q8VCF5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan10Q8VCF5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan10Q8VCF5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan10Q8VCF5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan10Q8VCF5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan10Q8VCF5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan10Q8VCF5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan10Q8VCF5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan10Q8VCF5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan10Q8VCF5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan10Q8VCF5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan10Q8VCF5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan10Q8VCF5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan10Q8VCF5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan10Q8VCF5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan10Q8VCF5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan10Q8VCF5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan10Q8VCF5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan10Q8VCF5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan10Q8VCF5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan10Q8VCF5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan10Q8VCF5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan10Q8VCF5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan10Q8VCF5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan10Q8VCF5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan10Q8VCF5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms