Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Dnaaf4Q8R368 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Dnaaf4Q8R368 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Dnaaf4Q8R368 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Dnaaf4Q8R368 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Dnaaf4Q8R368 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Dnaaf4Q8R368 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Dnaaf4Q8R368 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Dnaaf4Q8R368 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Dnaaf4Q8R368 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Dnaaf4Q8R368 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Dnaaf4Q8R368 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Dnaaf4Q8R368 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnaaf4Q8R368 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Dnaaf4Q8R368 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Dnaaf4Q8R368 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dnaaf4Q8R368 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnaaf4Q8R368 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnaaf4Q8R368 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dnaaf4Q8R368 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Dnaaf4Q8R368 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dnaaf4Q8R368 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Dnaaf4Q8R368 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnaaf4Q8R368 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Dnaaf4Q8R368 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnaaf4Q8R368 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnaaf4Q8R368 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnaaf4Q8R368 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnaaf4Q8R368 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnaaf4Q8R368 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnaaf4Q8R368 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Dnaaf4Q8R368 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dnaaf4Q8R368 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnaaf4Q8R368 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnaaf4Q8R368 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dnaaf4Q8R368 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnaaf4Q8R368 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnaaf4Q8R368 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnaaf4Q8R368 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Dnaaf4Q8R368 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Dnaaf4Q8R368 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Dnaaf4Q8R368 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Dnaaf4Q8R368 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Dnaaf4Q8R368 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Dnaaf4Q8R368 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Dnaaf4Q8R368 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Dnaaf4Q8R368 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Dnaaf4Q8R368 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Dnaaf4Q8R368 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Dnaaf4Q8R368 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Dnaaf4Q8R368 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Dnaaf4Q8R368 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Dnaaf4Q8R368 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Dnaaf4Q8R368 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Dnaaf4Q8R368 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Dnaaf4Q8R368 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Dnaaf4Q8R368 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Dnaaf4Q8R368 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnaaf4Q8R368 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Dnaaf4Q8R368 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnaaf4Q8R368 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Dnaaf4Q8R368 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Dnaaf4Q8R368 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Dnaaf4Q8R368 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Dnaaf4Q8R368 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Dnaaf4Q8R368 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Dnaaf4Q8R368 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Dnaaf4Q8R368 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Dnaaf4Q8R368 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Dnaaf4Q8R368 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Dnaaf4Q8R368 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Dnaaf4Q8R368 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Dnaaf4Q8R368 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Dnaaf4Q8R368 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Dnaaf4Q8R368 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Dnaaf4Q8R368 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Dnaaf4Q8R368 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Dnaaf4Q8R368 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Dnaaf4Q8R368 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Dnaaf4Q8R368 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Dnaaf4Q8R368 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Dnaaf4Q8R368 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Dnaaf4Q8R368 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms