Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Treml1Q8K558 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Treml1Q8K558 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Treml1Q8K558 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Treml1Q8K558 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Treml1Q8K558 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Treml1Q8K558 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Treml1Q8K558 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Treml1Q8K558 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Treml1Q8K558 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Treml1Q8K558 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Treml1Q8K558 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Treml1Q8K558 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Treml1Q8K558 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Treml1Q8K558 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Treml1Q8K558 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Treml1Q8K558 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Treml1Q8K558 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Treml1Q8K558 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Treml1Q8K558 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Treml1Q8K558 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Treml1Q8K558 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Treml1Q8K558 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Treml1Q8K558 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Treml1Q8K558 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Treml1Q8K558 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Treml1Q8K558 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Treml1Q8K558 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Treml1Q8K558 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Treml1Q8K558 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Treml1Q8K558 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Treml1Q8K558 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Treml1Q8K558 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Treml1Q8K558 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Treml1Q8K558 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Treml1Q8K558 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Treml1Q8K558 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Treml1Q8K558 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Treml1Q8K558 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Treml1Q8K558 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Treml1Q8K558 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Treml1Q8K558 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Treml1Q8K558 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Treml1Q8K558 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Treml1Q8K558 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Treml1Q8K558 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Treml1Q8K558 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Treml1Q8K558 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Treml1Q8K558 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Treml1Q8K558 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Treml1Q8K558 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Treml1Q8K558 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Treml1Q8K558 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Treml1Q8K558 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Treml1Q8K558 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Treml1Q8K558 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Treml1Q8K558 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Treml1Q8K558 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Treml1Q8K558 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Treml1Q8K558 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Treml1Q8K558 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Treml1Q8K558 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Treml1Q8K558 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Treml1Q8K558 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Treml1Q8K558 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Treml1Q8K558 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Treml1Q8K558 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Treml1Q8K558 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Treml1Q8K558 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Treml1Q8K558 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms