Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defb12Q8K4N3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Defb12Q8K4N3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defb12Q8K4N3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defb12Q8K4N3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defb12Q8K4N3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Defb12Q8K4N3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defb12Q8K4N3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defb12Q8K4N3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb12Q8K4N3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb12Q8K4N3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb12Q8K4N3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defb12Q8K4N3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defb12Q8K4N3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defb12Q8K4N3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defb12Q8K4N3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defb12Q8K4N3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defb12Q8K4N3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb12Q8K4N3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms