Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rp1l1Q8CGM2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rp1l1Q8CGM2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rp1l1Q8CGM2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rp1l1Q8CGM2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rp1l1Q8CGM2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Rp1l1Q8CGM2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rp1l1Q8CGM2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rp1l1Q8CGM2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rp1l1Q8CGM2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rp1l1Q8CGM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rp1l1Q8CGM2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rp1l1Q8CGM2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rp1l1Q8CGM2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rp1l1Q8CGM2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rp1l1Q8CGM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rp1l1Q8CGM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rp1l1Q8CGM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rp1l1Q8CGM2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rp1l1Q8CGM2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rp1l1Q8CGM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rp1l1Q8CGM2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rp1l1Q8CGM2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rp1l1Q8CGM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rp1l1Q8CGM2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rp1l1Q8CGM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rp1l1Q8CGM2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rp1l1Q8CGM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rp1l1Q8CGM2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rp1l1Q8CGM2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rp1l1Q8CGM2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rp1l1Q8CGM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rp1l1Q8CGM2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rp1l1Q8CGM2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rp1l1Q8CGM2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rp1l1Q8CGM2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rp1l1Q8CGM2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rp1l1Q8CGM2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Rp1l1Q8CGM2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rp1l1Q8CGM2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rp1l1Q8CGM2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rp1l1Q8CGM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rp1l1Q8CGM2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rp1l1Q8CGM2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rp1l1Q8CGM2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rp1l1Q8CGM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rp1l1Q8CGM2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rp1l1Q8CGM2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rp1l1Q8CGM2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rp1l1Q8CGM2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rp1l1Q8CGM2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rp1l1Q8CGM2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rp1l1Q8CGM2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rp1l1Q8CGM2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rp1l1Q8CGM2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rp1l1Q8CGM2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rp1l1Q8CGM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rp1l1Q8CGM2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rp1l1Q8CGM2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rp1l1Q8CGM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rp1l1Q8CGM2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rp1l1Q8CGM2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rp1l1Q8CGM2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rp1l1Q8CGM2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rp1l1Q8CGM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rp1l1Q8CGM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rp1l1Q8CGM2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rp1l1Q8CGM2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rp1l1Q8CGM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rp1l1Q8CGM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rp1l1Q8CGM2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rp1l1Q8CGM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rp1l1Q8CGM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms