Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccser1Q8C0C4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccser1Q8C0C4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccser1Q8C0C4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccser1Q8C0C4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccser1Q8C0C4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccser1Q8C0C4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccser1Q8C0C4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccser1Q8C0C4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccser1Q8C0C4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccser1Q8C0C4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccser1Q8C0C4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccser1Q8C0C4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccser1Q8C0C4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccser1Q8C0C4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccser1Q8C0C4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccser1Q8C0C4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccser1Q8C0C4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccser1Q8C0C4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccser1Q8C0C4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccser1Q8C0C4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccser1Q8C0C4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccser1Q8C0C4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccser1Q8C0C4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccser1Q8C0C4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccser1Q8C0C4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccser1Q8C0C4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccser1Q8C0C4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccser1Q8C0C4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccser1Q8C0C4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccser1Q8C0C4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccser1Q8C0C4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccser1Q8C0C4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccser1Q8C0C4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccser1Q8C0C4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccser1Q8C0C4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccser1Q8C0C4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccser1Q8C0C4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccser1Q8C0C4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccser1Q8C0C4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccser1Q8C0C4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccser1Q8C0C4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccser1Q8C0C4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccser1Q8C0C4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccser1Q8C0C4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccser1Q8C0C4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccser1Q8C0C4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccser1Q8C0C4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccser1Q8C0C4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccser1Q8C0C4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccser1Q8C0C4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccser1Q8C0C4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccser1Q8C0C4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccser1Q8C0C4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccser1Q8C0C4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccser1Q8C0C4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccser1Q8C0C4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccser1Q8C0C4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccser1Q8C0C4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccser1Q8C0C4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccser1Q8C0C4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccser1Q8C0C4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccser1Q8C0C4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccser1Q8C0C4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccser1Q8C0C4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccser1Q8C0C4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccser1Q8C0C4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccser1Q8C0C4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccser1Q8C0C4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms