Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps13cQ8BX70 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps13cQ8BX70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps13cQ8BX70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps13cQ8BX70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps13cQ8BX70 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps13cQ8BX70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps13cQ8BX70 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps13cQ8BX70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps13cQ8BX70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps13cQ8BX70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps13cQ8BX70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps13cQ8BX70 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps13cQ8BX70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps13cQ8BX70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps13cQ8BX70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps13cQ8BX70 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps13cQ8BX70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps13cQ8BX70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps13cQ8BX70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps13cQ8BX70 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps13cQ8BX70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps13cQ8BX70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps13cQ8BX70 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps13cQ8BX70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps13cQ8BX70 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps13cQ8BX70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps13cQ8BX70 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps13cQ8BX70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps13cQ8BX70 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps13cQ8BX70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps13cQ8BX70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps13cQ8BX70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps13cQ8BX70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps13cQ8BX70 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps13cQ8BX70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps13cQ8BX70 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps13cQ8BX70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps13cQ8BX70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps13cQ8BX70 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps13cQ8BX70 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps13cQ8BX70 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps13cQ8BX70 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps13cQ8BX70 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps13cQ8BX70 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps13cQ8BX70 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps13cQ8BX70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps13cQ8BX70 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps13cQ8BX70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps13cQ8BX70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps13cQ8BX70 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps13cQ8BX70 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps13cQ8BX70 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps13cQ8BX70 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps13cQ8BX70 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps13cQ8BX70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps13cQ8BX70 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps13cQ8BX70 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps13cQ8BX70 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps13cQ8BX70 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps13cQ8BX70 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps13cQ8BX70 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms