Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan9Q8BJU2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan9Q8BJU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan9Q8BJU2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan9Q8BJU2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan9Q8BJU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tspan9Q8BJU2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan9Q8BJU2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan9Q8BJU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan9Q8BJU2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan9Q8BJU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan9Q8BJU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan9Q8BJU2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan9Q8BJU2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan9Q8BJU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan9Q8BJU2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan9Q8BJU2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan9Q8BJU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan9Q8BJU2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan9Q8BJU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan9Q8BJU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan9Q8BJU2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan9Q8BJU2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan9Q8BJU2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan9Q8BJU2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan9Q8BJU2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan9Q8BJU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan9Q8BJU2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan9Q8BJU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan9Q8BJU2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan9Q8BJU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan9Q8BJU2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan9Q8BJU2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan9Q8BJU2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan9Q8BJU2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan9Q8BJU2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan9Q8BJU2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan9Q8BJU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan9Q8BJU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan9Q8BJU2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan9Q8BJU2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan9Q8BJU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan9Q8BJU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan9Q8BJU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan9Q8BJU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan9Q8BJU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan9Q8BJU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan9Q8BJU2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan9Q8BJU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan9Q8BJU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan9Q8BJU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan9Q8BJU2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan9Q8BJU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tspan9Q8BJU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan9Q8BJU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan9Q8BJU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan9Q8BJU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan9Q8BJU2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms