Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pknox2Q8BG99 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Pknox2Q8BG99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pknox2Q8BG99 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Pknox2Q8BG99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pknox2Q8BG99 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pknox2Q8BG99 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pknox2Q8BG99 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pknox2Q8BG99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pknox2Q8BG99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pknox2Q8BG99 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pknox2Q8BG99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pknox2Q8BG99 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pknox2Q8BG99 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pknox2Q8BG99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pknox2Q8BG99 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pknox2Q8BG99 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pknox2Q8BG99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pknox2Q8BG99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pknox2Q8BG99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Pknox2Q8BG99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pknox2Q8BG99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pknox2Q8BG99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pknox2Q8BG99 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pknox2Q8BG99 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pknox2Q8BG99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pknox2Q8BG99 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pknox2Q8BG99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pknox2Q8BG99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pknox2Q8BG99 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pknox2Q8BG99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pknox2Q8BG99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pknox2Q8BG99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pknox2Q8BG99 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pknox2Q8BG99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pknox2Q8BG99 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pknox2Q8BG99 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pknox2Q8BG99 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pknox2Q8BG99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pknox2Q8BG99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pknox2Q8BG99 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pknox2Q8BG99 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pknox2Q8BG99 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pknox2Q8BG99 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pknox2Q8BG99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pknox2Q8BG99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pknox2Q8BG99 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pknox2Q8BG99 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pknox2Q8BG99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pknox2Q8BG99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pknox2Q8BG99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pknox2Q8BG99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pknox2Q8BG99 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pknox2Q8BG99 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Pknox2Q8BG99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pknox2Q8BG99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pknox2Q8BG99 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pknox2Q8BG99 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pknox2Q8BG99 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pknox2Q8BG99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pknox2Q8BG99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pknox2Q8BG99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pknox2Q8BG99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pknox2Q8BG99 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pknox2Q8BG99 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pknox2Q8BG99 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pknox2Q8BG99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pknox2Q8BG99 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pknox2Q8BG99 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms