Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SnupnQ80W37 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SnupnQ80W37 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SnupnQ80W37 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SnupnQ80W37 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SnupnQ80W37 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SnupnQ80W37 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SnupnQ80W37 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SnupnQ80W37 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SnupnQ80W37 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SnupnQ80W37 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnupnQ80W37 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SnupnQ80W37 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnupnQ80W37 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SnupnQ80W37 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnupnQ80W37 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnupnQ80W37 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnupnQ80W37 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnupnQ80W37 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SnupnQ80W37 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SnupnQ80W37 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SnupnQ80W37 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnupnQ80W37 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnupnQ80W37 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnupnQ80W37 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnupnQ80W37 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnupnQ80W37 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnupnQ80W37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnupnQ80W37 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SnupnQ80W37 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SnupnQ80W37 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnupnQ80W37 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SnupnQ80W37 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SnupnQ80W37 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SnupnQ80W37 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SnupnQ80W37 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SnupnQ80W37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SnupnQ80W37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SnupnQ80W37 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnupnQ80W37 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SnupnQ80W37 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SnupnQ80W37 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnupnQ80W37 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SnupnQ80W37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SnupnQ80W37 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnupnQ80W37 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnupnQ80W37 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SnupnQ80W37 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SnupnQ80W37 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SnupnQ80W37 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnupnQ80W37 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SnupnQ80W37 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SnupnQ80W37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SnupnQ80W37 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SnupnQ80W37 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SnupnQ80W37 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SnupnQ80W37 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SnupnQ80W37 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnupnQ80W37 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnupnQ80W37 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SnupnQ80W37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SnupnQ80W37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms