Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dtx3Q80V91 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dtx3Q80V91 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dtx3Q80V91 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dtx3Q80V91 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dtx3Q80V91 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dtx3Q80V91 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dtx3Q80V91 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dtx3Q80V91 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3Q80V91 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dtx3Q80V91 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dtx3Q80V91 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dtx3Q80V91 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx3Q80V91 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dtx3Q80V91 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dtx3Q80V91 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dtx3Q80V91 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dtx3Q80V91 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dtx3Q80V91 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dtx3Q80V91 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dtx3Q80V91 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx3Q80V91 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx3Q80V91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dtx3Q80V91 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3Q80V91 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3Q80V91 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dtx3Q80V91 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dtx3Q80V91 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dtx3Q80V91 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dtx3Q80V91 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dtx3Q80V91 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dtx3Q80V91 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dtx3Q80V91 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dtx3Q80V91 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dtx3Q80V91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx3Q80V91 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dtx3Q80V91 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dtx3Q80V91 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dtx3Q80V91 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dtx3Q80V91 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dtx3Q80V91 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx3Q80V91 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx3Q80V91 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx3Q80V91 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx3Q80V91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms