Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Plxna4Q80UG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Plxna4Q80UG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Plxna4Q80UG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxna4Q80UG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Plxna4Q80UG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Plxna4Q80UG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Plxna4Q80UG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Plxna4Q80UG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Plxna4Q80UG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Plxna4Q80UG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Plxna4Q80UG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Plxna4Q80UG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Plxna4Q80UG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Plxna4Q80UG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Plxna4Q80UG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Plxna4Q80UG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Plxna4Q80UG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Plxna4Q80UG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Plxna4Q80UG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Plxna4Q80UG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Plxna4Q80UG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Plxna4Q80UG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Plxna4Q80UG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Plxna4Q80UG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Plxna4Q80UG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Plxna4Q80UG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Plxna4Q80UG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxna4Q80UG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Plxna4Q80UG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Plxna4Q80UG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Plxna4Q80UG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plxna4Q80UG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plxna4Q80UG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Plxna4Q80UG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plxna4Q80UG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plxna4Q80UG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Plxna4Q80UG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Plxna4Q80UG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plxna4Q80UG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plxna4Q80UG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plxna4Q80UG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plxna4Q80UG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Plxna4Q80UG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plxna4Q80UG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plxna4Q80UG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Plxna4Q80UG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plxna4Q80UG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Plxna4Q80UG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxna4Q80UG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxna4Q80UG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxna4Q80UG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plxna4Q80UG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plxna4Q80UG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Plxna4Q80UG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plxna4Q80UG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plxna4Q80UG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plxna4Q80UG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plxna4Q80UG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxna4Q80UG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plxna4Q80UG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plxna4Q80UG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plxna4Q80UG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plxna4Q80UG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxna4Q80UG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxna4Q80UG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Plxna4Q80UG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxna4Q80UG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plxna4Q80UG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1094 ms