Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syne2Q6ZWQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syne2Q6ZWQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syne2Q6ZWQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syne2Q6ZWQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne2Q6ZWQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syne2Q6ZWQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syne2Q6ZWQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syne2Q6ZWQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms