Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcp4l1Q6W8Q3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcp4l1Q6W8Q3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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