Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AY358078Q6UY53 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AY358078Q6UY53 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AY358078Q6UY53 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AY358078Q6UY53 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AY358078Q6UY53 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AY358078Q6UY53 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AY358078Q6UY53 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AY358078Q6UY53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AY358078Q6UY53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AY358078Q6UY53 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
AY358078Q6UY53 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AY358078Q6UY53 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AY358078Q6UY53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AY358078Q6UY53 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AY358078Q6UY53 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AY358078Q6UY53 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AY358078Q6UY53 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AY358078Q6UY53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AY358078Q6UY53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AY358078Q6UY53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AY358078Q6UY53 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AY358078Q6UY53 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AY358078Q6UY53 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AY358078Q6UY53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AY358078Q6UY53 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AY358078Q6UY53 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AY358078Q6UY53 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AY358078Q6UY53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AY358078Q6UY53 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AY358078Q6UY53 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AY358078Q6UY53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AY358078Q6UY53 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AY358078Q6UY53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AY358078Q6UY53 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AY358078Q6UY53 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AY358078Q6UY53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AY358078Q6UY53 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AY358078Q6UY53 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AY358078Q6UY53 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AY358078Q6UY53 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AY358078Q6UY53 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AY358078Q6UY53 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AY358078Q6UY53 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AY358078Q6UY53 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AY358078Q6UY53 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AY358078Q6UY53 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AY358078Q6UY53 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AY358078Q6UY53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AY358078Q6UY53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AY358078Q6UY53 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AY358078Q6UY53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AY358078Q6UY53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AY358078Q6UY53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AY358078Q6UY53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AY358078Q6UY53 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AY358078Q6UY53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AY358078Q6UY53 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AY358078Q6UY53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AY358078Q6UY53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AY358078Q6UY53 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AY358078Q6UY53 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AY358078Q6UY53 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AY358078Q6UY53 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms