Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm38Q62176 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm38Q62176 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm38Q62176 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm38Q62176 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm38Q62176 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm38Q62176 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm38Q62176 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm38Q62176 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm38Q62176 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbm38Q62176 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm38Q62176 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm38Q62176 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm38Q62176 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm38Q62176 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm38Q62176 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm38Q62176 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm38Q62176 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm38Q62176 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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