Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CcnhQ61458 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CcnhQ61458 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CcnhQ61458 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CcnhQ61458 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CcnhQ61458 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CcnhQ61458 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CcnhQ61458 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CcnhQ61458 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CcnhQ61458 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CcnhQ61458 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CcnhQ61458 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CcnhQ61458 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CcnhQ61458 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CcnhQ61458 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CcnhQ61458 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CcnhQ61458 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CcnhQ61458 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CcnhQ61458 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CcnhQ61458 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CcnhQ61458 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CcnhQ61458 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CcnhQ61458 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CcnhQ61458 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CcnhQ61458 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CcnhQ61458 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CcnhQ61458 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CcnhQ61458 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CcnhQ61458 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CcnhQ61458 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CcnhQ61458 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CcnhQ61458 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CcnhQ61458 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CcnhQ61458 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CcnhQ61458 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CcnhQ61458 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CcnhQ61458 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CcnhQ61458 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CcnhQ61458 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CcnhQ61458 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CcnhQ61458 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CcnhQ61458 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CcnhQ61458 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CcnhQ61458 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CcnhQ61458 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CcnhQ61458 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CcnhQ61458 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CcnhQ61458 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CcnhQ61458 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CcnhQ61458 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CcnhQ61458 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CcnhQ61458 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CcnhQ61458 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CcnhQ61458 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CcnhQ61458 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CcnhQ61458 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CcnhQ61458 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CcnhQ61458 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CcnhQ61458 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CcnhQ61458 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CcnhQ61458 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CcnhQ61458 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CcnhQ61458 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CcnhQ61458 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CcnhQ61458 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CcnhQ61458 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CcnhQ61458 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CcnhQ61458 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.2 ms