Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccne1Q61457 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccne1Q61457 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccne1Q61457 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccne1Q61457 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccne1Q61457 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccne1Q61457 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccne1Q61457 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccne1Q61457 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccne1Q61457 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccne1Q61457 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccne1Q61457 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccne1Q61457 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccne1Q61457 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccne1Q61457 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ccne1Q61457 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccne1Q61457 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccne1Q61457 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccne1Q61457 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccne1Q61457 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccne1Q61457 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccne1Q61457 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccne1Q61457 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccne1Q61457 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccne1Q61457 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccne1Q61457 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccne1Q61457 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccne1Q61457 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccne1Q61457 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccne1Q61457 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccne1Q61457 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccne1Q61457 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccne1Q61457 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccne1Q61457 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccne1Q61457 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccne1Q61457 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccne1Q61457 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccne1Q61457 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccne1Q61457 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccne1Q61457 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccne1Q61457 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccne1Q61457 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccne1Q61457 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccne1Q61457 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccne1Q61457 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccne1Q61457 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccne1Q61457 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccne1Q61457 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccne1Q61457 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccne1Q61457 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccne1Q61457 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccne1Q61457 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccne1Q61457 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccne1Q61457 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccne1Q61457 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccne1Q61457 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccne1Q61457 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccne1Q61457 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccne1Q61457 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccne1Q61457 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccne1Q61457 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccne1Q61457 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccne1Q61457 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccne1Q61457 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccne1Q61457 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccne1Q61457 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccne1Q61457 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccne1Q61457 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccne1Q61457 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccne1Q61457 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ccne1Q61457 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccne1Q61457 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccne1Q61457 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccne1Q61457 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccne1Q61457 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccne1Q61457 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccne1Q61457 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccne1Q61457 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccne1Q61457 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccne1Q61457 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccne1Q61457 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccne1Q61457 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccne1Q61457 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccne1Q61457 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccne1Q61457 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccne1Q61457 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccne1Q61457 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ccne1Q61457 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccne1Q61457 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccne1Q61457 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms