Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sim1Q61045 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sim1Q61045 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sim1Q61045 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sim1Q61045 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sim1Q61045 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sim1Q61045 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sim1Q61045 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sim1Q61045 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sim1Q61045 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sim1Q61045 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sim1Q61045 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sim1Q61045 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sim1Q61045 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sim1Q61045 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sim1Q61045 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sim1Q61045 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sim1Q61045 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sim1Q61045 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sim1Q61045 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sim1Q61045 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sim1Q61045 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sim1Q61045 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sim1Q61045 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sim1Q61045 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sim1Q61045 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sim1Q61045 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sim1Q61045 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sim1Q61045 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sim1Q61045 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sim1Q61045 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sim1Q61045 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sim1Q61045 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sim1Q61045 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sim1Q61045 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sim1Q61045 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sim1Q61045 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sim1Q61045 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sim1Q61045 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sim1Q61045 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sim1Q61045 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sim1Q61045 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sim1Q61045 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sim1Q61045 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sim1Q61045 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sim1Q61045 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sim1Q61045 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sim1Q61045 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sim1Q61045 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sim1Q61045 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sim1Q61045 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sim1Q61045 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sim1Q61045 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sim1Q61045 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sim1Q61045 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sim1Q61045 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sim1Q61045 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sim1Q61045 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sim1Q61045 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sim1Q61045 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sim1Q61045 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sim1Q61045 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sim1Q61045 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sim1Q61045 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sim1Q61045 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sim1Q61045 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sim1Q61045 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sim1Q61045 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sim1Q61045 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms