Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kpna1Q60960 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kpna1Q60960 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kpna1Q60960 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kpna1Q60960 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kpna1Q60960 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kpna1Q60960 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kpna1Q60960 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kpna1Q60960 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kpna1Q60960 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kpna1Q60960 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kpna1Q60960 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kpna1Q60960 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Kpna1Q60960 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kpna1Q60960 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Kpna1Q60960 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kpna1Q60960 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kpna1Q60960 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kpna1Q60960 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kpna1Q60960 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kpna1Q60960 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kpna1Q60960 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kpna1Q60960 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kpna1Q60960 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kpna1Q60960 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kpna1Q60960 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna1Q60960 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kpna1Q60960 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kpna1Q60960 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kpna1Q60960 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Kpna1Q60960 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kpna1Q60960 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kpna1Q60960 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kpna1Q60960 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kpna1Q60960 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kpna1Q60960 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kpna1Q60960 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kpna1Q60960 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kpna1Q60960 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kpna1Q60960 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kpna1Q60960 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kpna1Q60960 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kpna1Q60960 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kpna1Q60960 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kpna1Q60960 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Kpna1Q60960 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kpna1Q60960 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kpna1Q60960 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kpna1Q60960 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kpna1Q60960 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kpna1Q60960 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kpna1Q60960 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kpna1Q60960 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kpna1Q60960 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kpna1Q60960 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kpna1Q60960 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kpna1Q60960 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kpna1Q60960 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kpna1Q60960 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kpna1Q60960 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kpna1Q60960 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kpna1Q60960 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms