Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hs3st6Q5GFD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hs3st6Q5GFD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hs3st6Q5GFD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hs3st6Q5GFD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hs3st6Q5GFD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hs3st6Q5GFD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hs3st6Q5GFD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hs3st6Q5GFD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs3st6Q5GFD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hs3st6Q5GFD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hs3st6Q5GFD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hs3st6Q5GFD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hs3st6Q5GFD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hs3st6Q5GFD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hs3st6Q5GFD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hs3st6Q5GFD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hs3st6Q5GFD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hs3st6Q5GFD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hs3st6Q5GFD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hs3st6Q5GFD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hs3st6Q5GFD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hs3st6Q5GFD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hs3st6Q5GFD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs3st6Q5GFD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs3st6Q5GFD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hs3st6Q5GFD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hs3st6Q5GFD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hs3st6Q5GFD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hs3st6Q5GFD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hs3st6Q5GFD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hs3st6Q5GFD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hs3st6Q5GFD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hs3st6Q5GFD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hs3st6Q5GFD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hs3st6Q5GFD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hs3st6Q5GFD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hs3st6Q5GFD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hs3st6Q5GFD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hs3st6Q5GFD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hs3st6Q5GFD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hs3st6Q5GFD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hs3st6Q5GFD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hs3st6Q5GFD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hs3st6Q5GFD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hs3st6Q5GFD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hs3st6Q5GFD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hs3st6Q5GFD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hs3st6Q5GFD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hs3st6Q5GFD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hs3st6Q5GFD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hs3st6Q5GFD5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hs3st6Q5GFD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hs3st6Q5GFD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hs3st6Q5GFD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hs3st6Q5GFD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hs3st6Q5GFD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hs3st6Q5GFD5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hs3st6Q5GFD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hs3st6Q5GFD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hs3st6Q5GFD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hs3st6Q5GFD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hs3st6Q5GFD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hs3st6Q5GFD5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hs3st6Q5GFD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hs3st6Q5GFD5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hs3st6Q5GFD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hs3st6Q5GFD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hs3st6Q5GFD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hs3st6Q5GFD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hs3st6Q5GFD5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hs3st6Q5GFD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms