Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdp2Q504M2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdp2Q504M2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdp2Q504M2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdp2Q504M2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdp2Q504M2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdp2Q504M2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdp2Q504M2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdp2Q504M2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdp2Q504M2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdp2Q504M2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdp2Q504M2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdp2Q504M2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdp2Q504M2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdp2Q504M2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdp2Q504M2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdp2Q504M2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdp2Q504M2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdp2Q504M2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdp2Q504M2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdp2Q504M2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdp2Q504M2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdp2Q504M2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdp2Q504M2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdp2Q504M2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdp2Q504M2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdp2Q504M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdp2Q504M2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdp2Q504M2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdp2Q504M2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdp2Q504M2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdp2Q504M2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdp2Q504M2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdp2Q504M2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdp2Q504M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdp2Q504M2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdp2Q504M2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdp2Q504M2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdp2Q504M2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdp2Q504M2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdp2Q504M2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdp2Q504M2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdp2Q504M2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdp2Q504M2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdp2Q504M2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdp2Q504M2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdp2Q504M2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdp2Q504M2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdp2Q504M2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdp2Q504M2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdp2Q504M2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdp2Q504M2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdp2Q504M2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdp2Q504M2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdp2Q504M2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdp2Q504M2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdp2Q504M2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdp2Q504M2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdp2Q504M2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdp2Q504M2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdp2Q504M2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdp2Q504M2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms