Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srek1ip1Q4V9W2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srek1ip1Q4V9W2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srek1ip1Q4V9W2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srek1ip1Q4V9W2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srek1ip1Q4V9W2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srek1ip1Q4V9W2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srek1ip1Q4V9W2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srek1ip1Q4V9W2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srek1ip1Q4V9W2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srek1ip1Q4V9W2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srek1ip1Q4V9W2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srek1ip1Q4V9W2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srek1ip1Q4V9W2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srek1ip1Q4V9W2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srek1ip1Q4V9W2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Srek1ip1Q4V9W2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srek1ip1Q4V9W2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srek1ip1Q4V9W2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srek1ip1Q4V9W2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srek1ip1Q4V9W2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srek1ip1Q4V9W2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srek1ip1Q4V9W2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srek1ip1Q4V9W2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srek1ip1Q4V9W2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srek1ip1Q4V9W2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srek1ip1Q4V9W2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srek1ip1Q4V9W2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srek1ip1Q4V9W2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srek1ip1Q4V9W2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srek1ip1Q4V9W2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srek1ip1Q4V9W2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srek1ip1Q4V9W2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srek1ip1Q4V9W2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srek1ip1Q4V9W2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srek1ip1Q4V9W2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms