Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Srbd1Q497V5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Srbd1Q497V5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Srbd1Q497V5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Srbd1Q497V5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Srbd1Q497V5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Srbd1Q497V5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Srbd1Q497V5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Srbd1Q497V5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Srbd1Q497V5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Srbd1Q497V5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Srbd1Q497V5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Srbd1Q497V5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Srbd1Q497V5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Srbd1Q497V5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Srbd1Q497V5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Srbd1Q497V5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Srbd1Q497V5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Srbd1Q497V5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Srbd1Q497V5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Srbd1Q497V5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Srbd1Q497V5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Srbd1Q497V5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Srbd1Q497V5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Srbd1Q497V5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srbd1Q497V5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srbd1Q497V5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srbd1Q497V5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srbd1Q497V5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srbd1Q497V5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Srbd1Q497V5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Srbd1Q497V5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Srbd1Q497V5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Srbd1Q497V5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Srbd1Q497V5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Srbd1Q497V5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Srbd1Q497V5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Srbd1Q497V5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Srbd1Q497V5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Srbd1Q497V5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Srbd1Q497V5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Srbd1Q497V5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srbd1Q497V5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Srbd1Q497V5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srbd1Q497V5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srbd1Q497V5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Srbd1Q497V5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srbd1Q497V5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srbd1Q497V5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srbd1Q497V5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srbd1Q497V5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srbd1Q497V5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Srbd1Q497V5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srbd1Q497V5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srbd1Q497V5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srbd1Q497V5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srbd1Q497V5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srbd1Q497V5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Srbd1Q497V5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Srbd1Q497V5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srbd1Q497V5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srbd1Q497V5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srbd1Q497V5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms