Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec4Q497M3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec4Q497M3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec4Q497M3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec4Q497M3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec4Q497M3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apobec4Q497M3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec4Q497M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec4Q497M3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec4Q497M3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec4Q497M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec4Q497M3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec4Q497M3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec4Q497M3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec4Q497M3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec4Q497M3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec4Q497M3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec4Q497M3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec4Q497M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec4Q497M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec4Q497M3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec4Q497M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec4Q497M3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apobec4Q497M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec4Q497M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec4Q497M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apobec4Q497M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec4Q497M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec4Q497M3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apobec4Q497M3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec4Q497M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apobec4Q497M3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec4Q497M3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apobec4Q497M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec4Q497M3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec4Q497M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec4Q497M3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec4Q497M3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec4Q497M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec4Q497M3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec4Q497M3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec4Q497M3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apobec4Q497M3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apobec4Q497M3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec4Q497M3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apobec4Q497M3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec4Q497M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apobec4Q497M3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apobec4Q497M3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec4Q497M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms