Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad2Q3V0V0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad2Q3V0V0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldlrad2Q3V0V0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldlrad2Q3V0V0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldlrad2Q3V0V0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldlrad2Q3V0V0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ldlrad2Q3V0V0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldlrad2Q3V0V0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldlrad2Q3V0V0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldlrad2Q3V0V0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad2Q3V0V0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldlrad2Q3V0V0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldlrad2Q3V0V0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldlrad2Q3V0V0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldlrad2Q3V0V0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldlrad2Q3V0V0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldlrad2Q3V0V0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldlrad2Q3V0V0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ldlrad2Q3V0V0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ldlrad2Q3V0V0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ldlrad2Q3V0V0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad2Q3V0V0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad2Q3V0V0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad2Q3V0V0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad2Q3V0V0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad2Q3V0V0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldlrad2Q3V0V0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad2Q3V0V0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldlrad2Q3V0V0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldlrad2Q3V0V0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldlrad2Q3V0V0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ldlrad2Q3V0V0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ldlrad2Q3V0V0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ldlrad2Q3V0V0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ldlrad2Q3V0V0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ldlrad2Q3V0V0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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