Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q3UZV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q3UZV7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UZV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UZV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UZV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UZV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UZV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UZV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UZV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UZV7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UZV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UZV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UZV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UZV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UZV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UZV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UZV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UZV7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UZV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UZV7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UZV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UZV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UZV7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q3UZV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UZV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UZV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UZV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UZV7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3UZV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3UZV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3UZV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UZV7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3UZV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3UZV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3UZV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms