Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW41

Wfdc9, Protein WFDC9, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wfdc9Q3UW41 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wfdc9Q3UW41 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wfdc9Q3UW41 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Wfdc9Q3UW41 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wfdc9Q3UW41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Wfdc9Q3UW41 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Wfdc9Q3UW41 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Wfdc9Q3UW41 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Wfdc9Q3UW41 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wfdc9Q3UW41 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wfdc9Q3UW41 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wfdc9Q3UW41 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wfdc9Q3UW41 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wfdc9Q3UW41 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wfdc9Q3UW41 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wfdc9Q3UW41 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wfdc9Q3UW41 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wfdc9Q3UW41 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wfdc9Q3UW41 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wfdc9Q3UW41 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wfdc9Q3UW41 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wfdc9Q3UW41 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wfdc9Q3UW41 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wfdc9Q3UW41 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wfdc9Q3UW41 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Wfdc9Q3UW41 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wfdc9Q3UW41 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wfdc9Q3UW41 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wfdc9Q3UW41 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wfdc9Q3UW41 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wfdc9Q3UW41 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wfdc9Q3UW41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wfdc9Q3UW41 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wfdc9Q3UW41 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wfdc9Q3UW41 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wfdc9Q3UW41 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wfdc9Q3UW41 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wfdc9Q3UW41 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wfdc9Q3UW41 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wfdc9Q3UW41 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wfdc9Q3UW41 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wfdc9Q3UW41 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wfdc9Q3UW41 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wfdc9Q3UW41 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Wfdc9Q3UW41 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wfdc9Q3UW41 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wfdc9Q3UW41 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wfdc9Q3UW41 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wfdc9Q3UW41 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wfdc9Q3UW41 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wfdc9Q3UW41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wfdc9Q3UW41 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wfdc9Q3UW41 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wfdc9Q3UW41 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms