Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm29609Q3UU56 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm29609Q3UU56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm29609Q3UU56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm29609Q3UU56 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm29609Q3UU56 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm29609Q3UU56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm29609Q3UU56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm29609Q3UU56 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm29609Q3UU56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm29609Q3UU56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm29609Q3UU56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm29609Q3UU56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm29609Q3UU56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm29609Q3UU56 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm29609Q3UU56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm29609Q3UU56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm29609Q3UU56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm29609Q3UU56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm29609Q3UU56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm29609Q3UU56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm29609Q3UU56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm29609Q3UU56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm29609Q3UU56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm29609Q3UU56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm29609Q3UU56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm29609Q3UU56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm29609Q3UU56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm29609Q3UU56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm29609Q3UU56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm29609Q3UU56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm29609Q3UU56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm29609Q3UU56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm29609Q3UU56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm29609Q3UU56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm29609Q3UU56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm29609Q3UU56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm29609Q3UU56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm29609Q3UU56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm29609Q3UU56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm29609Q3UU56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm29609Q3UU56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm29609Q3UU56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm29609Q3UU56 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm29609Q3UU56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm29609Q3UU56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm29609Q3UU56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm29609Q3UU56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm29609Q3UU56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm29609Q3UU56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm29609Q3UU56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm29609Q3UU56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm29609Q3UU56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm29609Q3UU56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm29609Q3UU56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm29609Q3UU56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm29609Q3UU56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm29609Q3UU56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm29609Q3UU56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm29609Q3UU56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm29609Q3UU56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm29609Q3UU56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm29609Q3UU56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm29609Q3UU56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm29609Q3UU56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm29609Q3UU56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm29609Q3UU56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm29609Q3UU56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm29609Q3UU56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm29609Q3UU56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm29609Q3UU56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms