Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fchsd2Q3USJ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fchsd2Q3USJ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Fchsd2Q3USJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Fchsd2Q3USJ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fchsd2Q3USJ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fchsd2Q3USJ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fchsd2Q3USJ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fchsd2Q3USJ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fchsd2Q3USJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fchsd2Q3USJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fchsd2Q3USJ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fchsd2Q3USJ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Fchsd2Q3USJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fchsd2Q3USJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fchsd2Q3USJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Fchsd2Q3USJ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fchsd2Q3USJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Fchsd2Q3USJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fchsd2Q3USJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fchsd2Q3USJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fchsd2Q3USJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fchsd2Q3USJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fchsd2Q3USJ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fchsd2Q3USJ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Fchsd2Q3USJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Fchsd2Q3USJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fchsd2Q3USJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Fchsd2Q3USJ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fchsd2Q3USJ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fchsd2Q3USJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fchsd2Q3USJ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fchsd2Q3USJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fchsd2Q3USJ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fchsd2Q3USJ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fchsd2Q3USJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fchsd2Q3USJ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fchsd2Q3USJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fchsd2Q3USJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fchsd2Q3USJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fchsd2Q3USJ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fchsd2Q3USJ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fchsd2Q3USJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Fchsd2Q3USJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fchsd2Q3USJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fchsd2Q3USJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fchsd2Q3USJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fchsd2Q3USJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fchsd2Q3USJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fchsd2Q3USJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Fchsd2Q3USJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Fchsd2Q3USJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fchsd2Q3USJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fchsd2Q3USJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Fchsd2Q3USJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fchsd2Q3USJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fchsd2Q3USJ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Fchsd2Q3USJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fchsd2Q3USJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fchsd2Q3USJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fchsd2Q3USJ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fchsd2Q3USJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fchsd2Q3USJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fchsd2Q3USJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fchsd2Q3USJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fchsd2Q3USJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fchsd2Q3USJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fchsd2Q3USJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fchsd2Q3USJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fchsd2Q3USJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fchsd2Q3USJ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms