Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fhdc1Q3ULZ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fhdc1Q3ULZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fhdc1Q3ULZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fhdc1Q3ULZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fhdc1Q3ULZ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fhdc1Q3ULZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fhdc1Q3ULZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fhdc1Q3ULZ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fhdc1Q3ULZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Fhdc1Q3ULZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Fhdc1Q3ULZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fhdc1Q3ULZ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Fhdc1Q3ULZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Fhdc1Q3ULZ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fhdc1Q3ULZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fhdc1Q3ULZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fhdc1Q3ULZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fhdc1Q3ULZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fhdc1Q3ULZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fhdc1Q3ULZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fhdc1Q3ULZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fhdc1Q3ULZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fhdc1Q3ULZ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fhdc1Q3ULZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fhdc1Q3ULZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fhdc1Q3ULZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fhdc1Q3ULZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fhdc1Q3ULZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fhdc1Q3ULZ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fhdc1Q3ULZ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fhdc1Q3ULZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fhdc1Q3ULZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fhdc1Q3ULZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fhdc1Q3ULZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fhdc1Q3ULZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fhdc1Q3ULZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fhdc1Q3ULZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fhdc1Q3ULZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fhdc1Q3ULZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Fhdc1Q3ULZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fhdc1Q3ULZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fhdc1Q3ULZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fhdc1Q3ULZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fhdc1Q3ULZ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Fhdc1Q3ULZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Fhdc1Q3ULZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fhdc1Q3ULZ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fhdc1Q3ULZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Fhdc1Q3ULZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fhdc1Q3ULZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fhdc1Q3ULZ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fhdc1Q3ULZ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fhdc1Q3ULZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms