Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Lmod2Q3UHZ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Lmod2Q3UHZ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Lmod2Q3UHZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Lmod2Q3UHZ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Lmod2Q3UHZ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Lmod2Q3UHZ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Lmod2Q3UHZ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Lmod2Q3UHZ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Lmod2Q3UHZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Lmod2Q3UHZ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Lmod2Q3UHZ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Lmod2Q3UHZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lmod2Q3UHZ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
Lmod2Q3UHZ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Lmod2Q3UHZ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Lmod2Q3UHZ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Lmod2Q3UHZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Lmod2Q3UHZ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Lmod2Q3UHZ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Lmod2Q3UHZ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Lmod2Q3UHZ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Lmod2Q3UHZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Lmod2Q3UHZ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Lmod2Q3UHZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Lmod2Q3UHZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Lmod2Q3UHZ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Lmod2Q3UHZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Lmod2Q3UHZ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lmod2Q3UHZ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lmod2Q3UHZ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Lmod2Q3UHZ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Lmod2Q3UHZ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Lmod2Q3UHZ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Lmod2Q3UHZ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
Lmod2Q3UHZ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Lmod2Q3UHZ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lmod2Q3UHZ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Lmod2Q3UHZ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Lmod2Q3UHZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Lmod2Q3UHZ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Lmod2Q3UHZ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lmod2Q3UHZ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lmod2Q3UHZ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lmod2Q3UHZ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Lmod2Q3UHZ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Lmod2Q3UHZ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Lmod2Q3UHZ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Lmod2Q3UHZ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Lmod2Q3UHZ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Lmod2Q3UHZ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Lmod2Q3UHZ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lmod2Q3UHZ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Lmod2Q3UHZ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Lmod2Q3UHZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Lmod2Q3UHZ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Lmod2Q3UHZ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Lmod2Q3UHZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lmod2Q3UHZ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Lmod2Q3UHZ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Lmod2Q3UHZ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lmod2Q3UHZ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lmod2Q3UHZ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Lmod2Q3UHZ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lmod2Q3UHZ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Lmod2Q3UHZ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lmod2Q3UHZ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Lmod2Q3UHZ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Lmod2Q3UHZ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Lmod2Q3UHZ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lmod2Q3UHZ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Lmod2Q3UHZ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Lmod2Q3UHZ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Lmod2Q3UHZ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Lmod2Q3UHZ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Lmod2Q3UHZ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Lmod2Q3UHZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Lmod2Q3UHZ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Lmod2Q3UHZ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms