Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkd1l3Q2EG98 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkd1l3Q2EG98 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkd1l3Q2EG98 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd1l3Q2EG98 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd1l3Q2EG98 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd1l3Q2EG98 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd1l3Q2EG98 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd1l3Q2EG98 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd1l3Q2EG98 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd1l3Q2EG98 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd1l3Q2EG98 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd1l3Q2EG98 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkd1l3Q2EG98 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd1l3Q2EG98 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd1l3Q2EG98 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd1l3Q2EG98 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd1l3Q2EG98 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd1l3Q2EG98 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd1l3Q2EG98 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd1l3Q2EG98 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd1l3Q2EG98 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd1l3Q2EG98 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd1l3Q2EG98 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd1l3Q2EG98 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd1l3Q2EG98 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd1l3Q2EG98 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd1l3Q2EG98 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd1l3Q2EG98 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd1l3Q2EG98 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd1l3Q2EG98 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd1l3Q2EG98 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd1l3Q2EG98 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkd1l3Q2EG98 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkd1l3Q2EG98 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd1l3Q2EG98 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd1l3Q2EG98 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd1l3Q2EG98 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd1l3Q2EG98 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd1l3Q2EG98 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd1l3Q2EG98 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd1l3Q2EG98 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd1l3Q2EG98 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd1l3Q2EG98 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd1l3Q2EG98 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd1l3Q2EG98 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd1l3Q2EG98 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd1l3Q2EG98 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd1l3Q2EG98 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd1l3Q2EG98 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd1l3Q2EG98 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd1l3Q2EG98 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd1l3Q2EG98 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd1l3Q2EG98 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkd1l3Q2EG98 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd1l3Q2EG98 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd1l3Q2EG98 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd1l3Q2EG98 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd1l3Q2EG98 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms