Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 RPP2BYDR382W 333 nt12.33□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 MNP1YGL068W 585 nt12.33□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 BOR1YNL275W 1731 nt12.33□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 SRB2YHR041C 633 nt12.32□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 WWM1YFL010C 636 nt12.3□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 IRC15YPL017C 1500 nt12.3□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 RPP2AYOL039W 321 nt12.29□□□□□ -0.44
SEC39Q12745 GIS3YLR094C 1509 nt12.24□□□□□ -0.45
SEC39Q12745 YHL050CYHL050C 2094 nt12.23□□□□□ -0.45
SEC39Q12745 YBL100CYBL100C 315 nt12.21□□□□□ -0.45
SEC39Q12745 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.2□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 RKM5YLR137W 1104 nt12.2□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 PTK1YKL198C 1989 nt12.19□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 BOP3YNL042W 1191 nt12.19□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC39Q12745 BDH2YAL061W 1254 nt12.1□□□□□ -0.47
SEC39Q12745 ALF1YNL148C 765 nt12.09□□□□□ -0.47
SEC39Q12745 MCH5YOR306C 1566 nt12.06□□□□□ -0.48
SEC39Q12745 RRT12YCR045C 1476 nt12.05□□□□□ -0.48
SEC39Q12745 FUN26YAL022C 1554 nt12.03□□□□□ -0.48
SEC39Q12745 LSM3YLR438C-A 270 nt12.02□□□□□ -0.49
SEC39Q12745 PUS2YGL063W 1113 nt11.99□□□□□ -0.49
SEC39Q12745 YLR281CYLR281C 468 nt11.98□□□□□ -0.49
SEC39Q12745 RTS2YOR077W 699 nt11.95□□□□□ -0.5
SEC39Q12745 YFL054CYFL054C 1941 nt11.92□□□□□ -0.5
SEC39Q12745 GFD2YCL036W 1701 nt11.91□□□□□ -0.5
SEC39Q12745 SIS1YNL007C 1059 nt11.9□□□□□ -0.5
SEC39Q12745 MOT3YMR070W 1473 nt11.89□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 WHI5YOR083W 888 nt11.89□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 SPT8YLR055C 1809 nt11.88□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 YNL195CYNL195C 786 nt11.88□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 ALG12YNR030W 1656 nt11.85□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 ART5YGR068C 1761 nt11.84□□□□□ -0.51
SEC39Q12745 HSP60YLR259C 1719 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC39Q12745 NCP1YHR042W 2076 nt11.8□□□□□ -0.52
SEC39Q12745 YJL225CYJL225C 5277 nt11.8□□□□□ -0.52
SEC39Q12745 TRM9YML014W 840 nt11.79□□□□□ -0.52
SEC39Q12745 CUE1YMR264W 612 nt11.79□□□□□ -0.52
SEC39Q12745 IMP2'YIL154C 1041 nt11.76□□□□□ -0.53
SEC39Q12745 CCT6YDR188W 1641 nt11.74□□□□□ -0.53
SEC39Q12745 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC39Q12745 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC39Q12745 DSK2YMR276W 1122 nt11.72□□□□□ -0.53
SEC39Q12745 FMP45YDL222C 930 nt11.69□□□□□ -0.54
SEC39Q12745 PET9YBL030C 957 nt11.68□□□□□ -0.54
SEC39Q12745 YIL100WYIL100W 354 nt11.67□□□□□ -0.54
SEC39Q12745 MRPL8YJL063C 717 nt11.64□□□□□ -0.55
SEC39Q12745 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.64□□□□□ -0.55
SEC39Q12745 YCH1YGR203W 447 nt11.62□□□□□ -0.55
SEC39Q12745 SWE1YJL187C 2460 nt11.6□□□□□ -0.55
SEC39Q12745 GLK1YCL040W 1503 nt11.59□□□□□ -0.55
SEC39Q12745 YLR236CYLR236C 324 nt11.58□□□□□ -0.56
SEC39Q12745 NAR1YNL240C 1476 nt11.54□□□□□ -0.56
SEC39Q12745 YPR011CYPR011C 981 nt11.53□□□□□ -0.56
SEC39Q12745 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.5□□□□□ -0.57
SEC39Q12745 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.5□□□□□ -0.57
SEC39Q12745 ADO1YJR105W 1023 nt11.49□□□□□ -0.57
SEC39Q12745 LCB1YMR296C 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 YJL152WYJL152W 360 nt11.43□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 IDH1YNL037C 1083 nt11.43□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 ERV46YAL042W 1248 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 TIR4YOR009W 1464 nt11.4□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 YMR057CYMR057C 372 nt11.4□□□□□ -0.58
SEC39Q12745 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.36□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 YEL076CYEL076C 651 nt11.36□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 YLR464WYLR464W 651 nt11.36□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 LPX1YOR084W 1164 nt11.36□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 AAC1YMR056C 930 nt11.34□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 FUR4YBR021W 1902 nt11.34□□□□□ -0.59
SEC39Q12745 YDR433WYDR433W 441 nt11.29□□□□□ -0.6
SEC39Q12745 PRP4YPR178W 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
SEC39Q12745 YKR040CYKR040C 504 nt11.26□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 CMP2YML057W 1815 nt11.24□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 RTG1YOL067C 534 nt11.24□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 SPP1YPL138C 1062 nt11.23□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 DPS1YLL018C 1674 nt11.22□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 GBP2YCL011C 1284 nt11.22□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 BIO4YNR057C 714 nt11.21□□□□□ -0.61
SEC39Q12745 BIO5YNR056C 1686 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC39Q12745 CYT2YKL087C 675 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC39Q12745 LYS4YDR234W 2082 nt11.19□□□□□ -0.62
SEC39Q12745 PBP1YGR178C 2169 nt11.18□□□□□ -0.62
SEC39Q12745 UBX6YJL048C 1191 nt11.17□□□□□ -0.62
SEC39Q12745 HUA1YGR268C 597 nt11.14□□□□□ -0.63
SEC39Q12745 HSL7YBR133C 2484 nt11.14□□□□□ -0.63
SEC39Q12745 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.11□□□□□ -0.63
SEC39Q12745 BMT6YLR063W 1098 nt11.1□□□□□ -0.63
SEC39Q12745 SNF1YDR477W 1902 nt11.09□□□□□ -0.63
SEC39Q12745 MXR2YCL033C 507 nt11.08□□□□□ -0.64
SEC39Q12745 TCD2YKL027W 1344 nt11.07□□□□□ -0.64
SEC39Q12745 SIM1YIL123W 1431 nt11.04□□□□□ -0.64
SEC39Q12745 YDR094WYDR094W 336 nt11.04□□□□□ -0.64
SEC39Q12745 YKR005CYKR005C 1578 nt10.98□□□□□ -0.65
SEC39Q12745 CCA1YER168C 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
SEC39Q12745 DED1YOR204W 1815 nt10.95□□□□□ -0.66
SEC39Q12745 HEL2YDR266C 1920 nt10.93□□□□□ -0.66
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