Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.83□□□□□ -0.52
NSI1Q12457 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.83□□□□□ -0.52
NSI1Q12457 CAC2YML102W 1407 nt11.83□□□□□ -0.52
NSI1Q12457 SIS1YNL007C 1059 nt11.79□□□□□ -0.52
NSI1Q12457 YOL037CYOL037C 354 nt11.78□□□□□ -0.52
NSI1Q12457 YMR090WYMR090W 684 nt11.76□□□□□ -0.53
NSI1Q12457 YDL221WYDL221W 552 nt11.72□□□□□ -0.53
NSI1Q12457 ART5YGR068C 1761 nt11.68□□□□□ -0.54
NSI1Q12457 YBR220CYBR220C 1683 nt11.66□□□□□ -0.54
NSI1Q12457 GFD2YCL036W 1701 nt11.63□□□□□ -0.55
NSI1Q12457 IRC15YPL017C 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
NSI1Q12457 SDH1YKL148C 1923 nt11.61□□□□□ -0.55
NSI1Q12457 RTS2YOR077W 699 nt11.58□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 TIR4YOR009W 1464 nt11.57□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.56□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.56□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.56□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.56□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.56□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 PET9YBL030C 957 nt11.55□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 GIS3YLR094C 1509 nt11.55□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 SCC4YER147C 1875 nt11.53□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 YLR281CYLR281C 468 nt11.53□□□□□ -0.56
NSI1Q12457 YMR057CYMR057C 372 nt11.52□□□□□ -0.57
NSI1Q12457 YJL152WYJL152W 360 nt11.51□□□□□ -0.57
NSI1Q12457 WHI5YOR083W 888 nt11.49□□□□□ -0.57
NSI1Q12457 YCH1YGR203W 447 nt11.48□□□□□ -0.57
NSI1Q12457 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.48□□□□□ -0.57
NSI1Q12457 PUS2YGL063W 1113 nt11.41□□□□□ -0.58
NSI1Q12457 CUE1YMR264W 612 nt11.39□□□□□ -0.59
NSI1Q12457 FPS1YLL043W 2010 nt11.33□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 PCH2YBR186W 1695 nt11.31□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.31□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 YSC84YHR016C 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 YGR139WYGR139W 339 nt11.29□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 YIL100WYIL100W 354 nt11.29□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 GUT2YIL155C 1950 nt11.28□□□□□ -0.6
NSI1Q12457 YPR011CYPR011C 981 nt11.27□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 RRT12YCR045C 1476 nt11.26□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 YLR236CYLR236C 324 nt11.26□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 SEC11YIR022W 504 nt11.24□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 DSK2YMR276W 1122 nt11.24□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 YNL195CYNL195C 786 nt11.21□□□□□ -0.61
NSI1Q12457 YHL050CYHL050C 2094 nt11.2□□□□□ -0.62
NSI1Q12457 IMP2'YIL154C 1041 nt11.2□□□□□ -0.62
NSI1Q12457 IDH1YNL037C 1083 nt11.17□□□□□ -0.62
NSI1Q12457 GBP2YCL011C 1284 nt11.14□□□□□ -0.63
NSI1Q12457 FMP45YDL222C 930 nt11.12□□□□□ -0.63
NSI1Q12457 RRD1YIL153W 1182 nt11.05□□□□□ -0.64
NSI1Q12457 LPX1YOR084W 1164 nt11.04□□□□□ -0.64
NSI1Q12457 YDR433WYDR433W 441 nt11.03□□□□□ -0.64
NSI1Q12457 ERV46YAL042W 1248 nt11.03□□□□□ -0.64
NSI1Q12457 PIB2YGL023C 1908 nt11.03□□□□□ -0.64
NSI1Q12457 TCD2YKL027W 1344 nt11.02□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 DED1YOR204W 1815 nt11□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 MXR2YCL033C 507 nt10.99□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 RTF1YGL244W 1677 nt10.98□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 UME6YDR207C 2511 nt10.97□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 MRPL8YJL063C 717 nt10.96□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 NME1NME1 340 nt10.96□□□□□ -0.65
NSI1Q12457 FMT1YBL013W 1206 nt10.94□□□□□ -0.66
NSI1Q12457 BOR1YNL275W 1731 nt10.93□□□□□ -0.66
NSI1Q12457 BOP3YNL042W 1191 nt10.93□□□□□ -0.66
NSI1Q12457 YKR040CYKR040C 504 nt10.92□□□□□ -0.66
NSI1Q12457 FMP52YER004W 696 nt10.88□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 CWP1YKL096W 720 nt10.88□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 PCM1YEL058W 1674 nt10.88□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 ADH2YMR303C 1047 nt10.87□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 SPP1YPL138C 1062 nt10.85□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 LCB1YMR296C 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
NSI1Q12457 NCP1YHR042W 2076 nt10.83□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 ADO1YJR105W 1023 nt10.81□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 YCL042WYCL042W 360 nt10.81□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 SIM1YIL123W 1431 nt10.81□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 PTK1YKL198C 1989 nt10.8□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 SNF6YHL025W 999 nt10.79□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 FRD1YEL047C 1413 nt10.78□□□□□ -0.68
NSI1Q12457 SOR2YDL246C 1074 nt10.74□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 SOR1YJR159W 1074 nt10.74□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.72□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 YEL076CYEL076C 651 nt10.72□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 YLR464WYLR464W 651 nt10.72□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 BIO4YNR057C 714 nt10.71□□□□□ -0.69
NSI1Q12457 YFL054CYFL054C 1941 nt10.67□□□□□ -0.7
NSI1Q12457 MCH5YOR306C 1566 nt10.65□□□□□ -0.7
NSI1Q12457 RTG1YOL067C 534 nt10.65□□□□□ -0.7
NSI1Q12457 YIH1YCR059C 777 nt10.61□□□□□ -0.71
NSI1Q12457 YLL053CYLL053C 459 nt10.6□□□□□ -0.71
NSI1Q12457 RNQ1YCL028W 1218 nt10.6□□□□□ -0.71
NSI1Q12457 PTH1YHR189W 573 nt10.59□□□□□ -0.71
NSI1Q12457 YJL225CYJL225C 5277 nt10.59□□□□□ -0.71
NSI1Q12457 LYS4YDR234W 2082 nt10.58□□□□□ -0.72
NSI1Q12457 DIC1YLR348C 897 nt10.56□□□□□ -0.72
NSI1Q12457 UBX6YJL048C 1191 nt10.55□□□□□ -0.72
NSI1Q12457 ERF2YLR246W 1080 nt10.53□□□□□ -0.72
NSI1Q12457 HUA1YGR268C 597 nt10.52□□□□□ -0.73
NSI1Q12457 YLR235CYLR235C 399 nt10.51□□□□□ -0.73
NSI1Q12457 SPT8YLR055C 1809 nt10.51□□□□□ -0.73
NSI1Q12457 ATF2YGR177C 1608 nt10.49□□□□□ -0.73
NSI1Q12457 CRR1YLR213C 1269 nt10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 178.5 ms