Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YLR281CYLR281C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
LDB17Q12342 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.4□□□□□ -0.42
LDB17Q12342 ART5YGR068C 1761 nt12.39□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 YDL221WYDL221W 552 nt12.39□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 WHI5YOR083W 888 nt12.38□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 GFD2YCL036W 1701 nt12.37□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 TIR4YOR009W 1464 nt12.36□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 PET9YBL030C 957 nt12.36□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 YMR090WYMR090W 684 nt12.36□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 TAT1YBR069C 1860 nt12.36□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 YCH1YGR203W 447 nt12.34□□□□□ -0.43
LDB17Q12342 YBR220CYBR220C 1683 nt12.32□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 IRC15YPL017C 1500 nt12.3□□□□□ -0.44
LDB17Q12342 YJL152WYJL152W 360 nt12.24□□□□□ -0.45
LDB17Q12342 SDH1YKL148C 1923 nt12.24□□□□□ -0.45
LDB17Q12342 PUS2YGL063W 1113 nt12.22□□□□□ -0.45
LDB17Q12342 YMR057CYMR057C 372 nt12.21□□□□□ -0.45
LDB17Q12342 GIS3YLR094C 1509 nt12.21□□□□□ -0.46
LDB17Q12342 RTS2YOR077W 699 nt12.17□□□□□ -0.46
LDB17Q12342 SCC4YER147C 1875 nt12.14□□□□□ -0.47
LDB17Q12342 IMP2'YIL154C 1041 nt12.12□□□□□ -0.47
LDB17Q12342 CUE1YMR264W 612 nt12.12□□□□□ -0.47
LDB17Q12342 FPS1YLL043W 2010 nt12.11□□□□□ -0.47
LDB17Q12342 DSK2YMR276W 1122 nt12.1□□□□□ -0.47
LDB17Q12342 YPR011CYPR011C 981 nt12.08□□□□□ -0.48
LDB17Q12342 YLR236CYLR236C 324 nt12.06□□□□□ -0.48
LDB17Q12342 IDH1YNL037C 1083 nt12.05□□□□□ -0.48
LDB17Q12342 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.05□□□□□ -0.48
LDB17Q12342 GBP2YCL011C 1284 nt11.96□□□□□ -0.49
LDB17Q12342 PAC11YDR488C 1602 nt11.95□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 YIL100WYIL100W 354 nt11.93□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 PCH2YBR186W 1695 nt11.91□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 SEC11YIR022W 504 nt11.91□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 FMP45YDL222C 930 nt11.9□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 ERV46YAL042W 1248 nt11.9□□□□□ -0.5
LDB17Q12342 RRD1YIL153W 1182 nt11.89□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 GUT2YIL155C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 DED1YOR204W 1815 nt11.86□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 YDR433WYDR433W 441 nt11.85□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 LPX1YOR084W 1164 nt11.85□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 TCD2YKL027W 1344 nt11.85□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 YSC84YHR016C 1407 nt11.84□□□□□ -0.51
LDB17Q12342 YHL050CYHL050C 2094 nt11.82□□□□□ -0.52
LDB17Q12342 YKR040CYKR040C 504 nt11.8□□□□□ -0.52
LDB17Q12342 RRT12YCR045C 1476 nt11.8□□□□□ -0.52
LDB17Q12342 MXR2YCL033C 507 nt11.79□□□□□ -0.52
LDB17Q12342 YNL195CYNL195C 786 nt11.78□□□□□ -0.52
LDB17Q12342 MOT3YMR070W 1473 nt11.76□□□□□ -0.53
LDB17Q12342 FMP52YER004W 696 nt11.75□□□□□ -0.53
LDB17Q12342 FMT1YBL013W 1206 nt11.75□□□□□ -0.53
LDB17Q12342 PIB2YGL023C 1908 nt11.72□□□□□ -0.53
LDB17Q12342 Q0182Q0182 405 nt11.71□□□□□ -0.53
LDB17Q12342 SOR2YDL246C 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
LDB17Q12342 SOR1YJR159W 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
LDB17Q12342 FRD1YEL047C 1413 nt11.64□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 PCM1YEL058W 1674 nt11.61□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 RTF1YGL244W 1677 nt11.6□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 CWP1YKL096W 720 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 ADH2YMR303C 1047 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 SPP1YPL138C 1062 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 YCL042WYCL042W 360 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 NVJ2YPR091C 2313 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB17Q12342 BOP3YNL042W 1191 nt11.53□□□□□ -0.56
LDB17Q12342 NCP1YHR042W 2076 nt11.52□□□□□ -0.57
LDB17Q12342 SNF6YHL025W 999 nt11.51□□□□□ -0.57
LDB17Q12342 LCB1YMR296C 1677 nt11.49□□□□□ -0.57
LDB17Q12342 YJL225CYJL225C 5277 nt11.48□□□□□ -0.57
LDB17Q12342 PTK1YKL198C 1989 nt11.45□□□□□ -0.58
LDB17Q12342 YIH1YCR059C 777 nt11.44□□□□□ -0.58
LDB17Q12342 SIM1YIL123W 1431 nt11.43□□□□□ -0.58
LDB17Q12342 BIO4YNR057C 714 nt11.41□□□□□ -0.58
LDB17Q12342 RNQ1YCL028W 1218 nt11.41□□□□□ -0.58
LDB17Q12342 RTG1YOL067C 534 nt11.37□□□□□ -0.59
LDB17Q12342 PTH1YHR189W 573 nt11.36□□□□□ -0.59
LDB17Q12342 YLR235CYLR235C 399 nt11.36□□□□□ -0.59
LDB17Q12342 DIC1YLR348C 897 nt11.35□□□□□ -0.59
LDB17Q12342 YLL053CYLL053C 459 nt11.32□□□□□ -0.6
LDB17Q12342 MRPL8YJL063C 717 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB17Q12342 LYS4YDR234W 2082 nt11.28□□□□□ -0.6
LDB17Q12342 YKL030WYKL030W 606 nt11.28□□□□□ -0.6
LDB17Q12342 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.27□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 YEL076CYEL076C 651 nt11.27□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 YLR464WYLR464W 651 nt11.27□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 ERF2YLR246W 1080 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 TIM23YNR017W 669 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 FTR1YER145C 1215 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 CRR1YLR213C 1269 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB17Q12342 GAL1YBR020W 1587 nt11.2□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 ATF2YGR177C 1608 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 YFL054CYFL054C 1941 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 YLR179CYLR179C 606 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 AQY1YPR192W 918 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB17Q12342 ADO1YJR105W 1023 nt11.17□□□□□ -0.62
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