Protein–RNA interactions for Protein: Q12324

YVC1, Calcium channel YVC1, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YVC1Q12324 ALF1YNL148C 765 nt12.12□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 GUT2YIL155C 1950 nt12.11□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 YDL221WYDL221W 552 nt12.1□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 SIS1YNL007C 1059 nt12.1□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 BOR1YNL275W 1731 nt12.09□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 MNP1YGL068W 585 nt12.07□□□□□ -0.48
YVC1Q12324 SDH1YKL148C 1923 nt12.03□□□□□ -0.48
YVC1Q12324 IRC15YPL017C 1500 nt12.02□□□□□ -0.48
YVC1Q12324 YMR090WYMR090W 684 nt12□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 SEC11YIR022W 504 nt11.96□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 ART5YGR068C 1761 nt11.96□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 GFD2YCL036W 1701 nt11.96□□□□□ -0.49
YVC1Q12324 MCH5YOR306C 1566 nt11.96□□□□□ -0.5
YVC1Q12324 RKM5YLR137W 1104 nt11.95□□□□□ -0.5
YVC1Q12324 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
YVC1Q12324 SCC4YER147C 1875 nt11.89□□□□□ -0.51
YVC1Q12324 TIR4YOR009W 1464 nt11.84□□□□□ -0.51
YVC1Q12324 RTS2YOR077W 699 nt11.83□□□□□ -0.52
YVC1Q12324 PET9YBL030C 957 nt11.82□□□□□ -0.52
YVC1Q12324 PIB2YGL023C 1908 nt11.82□□□□□ -0.52
YVC1Q12324 NPL3YDR432W 1245 nt11.81□□□□□ -0.52
YVC1Q12324 YOL037CYOL037C 354 nt11.77□□□□□ -0.53
YVC1Q12324 YMR057CYMR057C 372 nt11.71□□□□□ -0.53
YVC1Q12324 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 CUE1YMR264W 612 nt11.7□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 YOR139CYOR139C 393 nt11.69□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 YHL050CYHL050C 2094 nt11.67□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 RTF1YGL244W 1677 nt11.66□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 YSC84YHR016C 1407 nt11.66□□□□□ -0.54
YVC1Q12324 YJL225CYJL225C 5277 nt11.62□□□□□ -0.55
YVC1Q12324 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.62□□□□□ -0.55
YVC1Q12324 RRT12YCR045C 1476 nt11.61□□□□□ -0.55
YVC1Q12324 ALG12YNR030W 1656 nt11.6□□□□□ -0.55
YVC1Q12324 YJL152WYJL152W 360 nt11.53□□□□□ -0.56
YVC1Q12324 YLR281CYLR281C 468 nt11.47□□□□□ -0.57
YVC1Q12324 WHI5YOR083W 888 nt11.47□□□□□ -0.57
YVC1Q12324 PTK1YKL198C 1989 nt11.47□□□□□ -0.57
YVC1Q12324 YIL100WYIL100W 354 nt11.45□□□□□ -0.58
YVC1Q12324 BOP3YNL042W 1191 nt11.45□□□□□ -0.58
YVC1Q12324 YLR236CYLR236C 324 nt11.42□□□□□ -0.58
YVC1Q12324 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.39□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 NCP1YHR042W 2076 nt11.39□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 RPM1RPM1 483 nt11.36□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 YNL195CYNL195C 786 nt11.36□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 HSP60YLR259C 1719 nt11.35□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 RRD1YIL153W 1182 nt11.34□□□□□ -0.59
YVC1Q12324 PUS2YGL063W 1113 nt11.32□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 DED1YOR204W 1815 nt11.3□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 IMP2'YIL154C 1041 nt11.29□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 YPR011CYPR011C 981 nt11.28□□□□□ -0.6
YVC1Q12324 NAR1YNL240C 1476 nt11.26□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 LCB1YMR296C 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 FMT1YBL013W 1206 nt11.23□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 IDH1YNL037C 1083 nt11.23□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 GBP2YCL011C 1284 nt11.23□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 YGR139WYGR139W 339 nt11.21□□□□□ -0.61
YVC1Q12324 YFL054CYFL054C 1941 nt11.2□□□□□ -0.62
YVC1Q12324 SPT8YLR055C 1809 nt11.19□□□□□ -0.62
YVC1Q12324 DSK2YMR276W 1122 nt11.18□□□□□ -0.62
YVC1Q12324 FMP52YER004W 696 nt11.12□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 TCD2YKL027W 1344 nt11.11□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 PCM1YEL058W 1674 nt11.11□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 FMP45YDL222C 930 nt11.11□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 MXR2YCL033C 507 nt11.11□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 CMP2YML057W 1815 nt11.1□□□□□ -0.63
YVC1Q12324 ADH2YMR303C 1047 nt11.07□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 GLK1YCL040W 1503 nt11.06□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 YDR433WYDR433W 441 nt11.05□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 LPX1YOR084W 1164 nt11.05□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 LYS4YDR234W 2082 nt11.05□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 ERV46YAL042W 1248 nt11.04□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 NME1NME1 340 nt11.04□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 HSL7YBR133C 2484 nt11.03□□□□□ -0.64
YVC1Q12324 CWP1YKL096W 720 nt11.02□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 SOR2YDL246C 1074 nt11.01□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 SOR1YJR159W 1074 nt11.01□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 SIM1YIL123W 1431 nt11.01□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 BIO4YNR057C 714 nt10.99□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 FRD1YEL047C 1413 nt10.97□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 HEL2YDR266C 1920 nt10.97□□□□□ -0.65
YVC1Q12324 YKR040CYKR040C 504 nt10.95□□□□□ -0.66
YVC1Q12324 SNF6YHL025W 999 nt10.94□□□□□ -0.66
YVC1Q12324 YIH1YCR059C 777 nt10.88□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 AAC1YMR056C 930 nt10.86□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 YCL042WYCL042W 360 nt10.86□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 SWE1YJL187C 2460 nt10.85□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 CYT2YKL087C 675 nt10.84□□□□□ -0.67
YVC1Q12324 MET2YNL277W 1461 nt10.82□□□□□ -0.68
YVC1Q12324 YLL053CYLL053C 459 nt10.81□□□□□ -0.68
YVC1Q12324 RNQ1YCL028W 1218 nt10.81□□□□□ -0.68
YVC1Q12324 CRR1YLR213C 1269 nt10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms