Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YGR021WYGR021W 873 nt11.61□□□□□ -0.55
HER1Q12276 TRM9YML014W 840 nt11.6□□□□□ -0.55
HER1Q12276 GIS3YLR094C 1509 nt11.6□□□□□ -0.55
HER1Q12276 HOM6YJR139C 1080 nt11.56□□□□□ -0.56
HER1Q12276 SIS1YNL007C 1059 nt11.54□□□□□ -0.56
HER1Q12276 YSC84YHR016C 1407 nt11.53□□□□□ -0.56
HER1Q12276 CCT6YDR188W 1641 nt11.51□□□□□ -0.57
HER1Q12276 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
HER1Q12276 LSM3YLR438C-A 270 nt11.51□□□□□ -0.57
HER1Q12276 PIB2YGL023C 1908 nt11.5□□□□□ -0.57
HER1Q12276 NPL3YDR432W 1245 nt11.49□□□□□ -0.57
HER1Q12276 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.49□□□□□ -0.57
HER1Q12276 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.49□□□□□ -0.57
HER1Q12276 MOT3YMR070W 1473 nt11.49□□□□□ -0.57
HER1Q12276 MNP1YGL068W 585 nt11.47□□□□□ -0.57
HER1Q12276 GFD2YCL036W 1701 nt11.46□□□□□ -0.58
HER1Q12276 RTF1YGL244W 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
HER1Q12276 RTS2YOR077W 699 nt11.43□□□□□ -0.58
HER1Q12276 YHL050CYHL050C 2094 nt11.43□□□□□ -0.58
HER1Q12276 ART5YGR068C 1761 nt11.43□□□□□ -0.58
HER1Q12276 RKM5YLR137W 1104 nt11.39□□□□□ -0.59
HER1Q12276 RRT12YCR045C 1476 nt11.33□□□□□ -0.6
HER1Q12276 BOP3YNL042W 1191 nt11.33□□□□□ -0.6
HER1Q12276 PET9YBL030C 957 nt11.32□□□□□ -0.6
HER1Q12276 CUE1YMR264W 612 nt11.31□□□□□ -0.6
HER1Q12276 YNL195CYNL195C 786 nt11.29□□□□□ -0.6
HER1Q12276 YOL037CYOL037C 354 nt11.29□□□□□ -0.6
HER1Q12276 PTK1YKL198C 1989 nt11.24□□□□□ -0.61
HER1Q12276 YCH1YGR203W 447 nt11.22□□□□□ -0.61
HER1Q12276 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 YIL100WYIL100W 354 nt11.2□□□□□ -0.62
HER1Q12276 TIR4YOR009W 1464 nt11.15□□□□□ -0.62
HER1Q12276 YMR057CYMR057C 372 nt11.1□□□□□ -0.63
HER1Q12276 YJL225CYJL225C 5277 nt11.06□□□□□ -0.64
HER1Q12276 YLR236CYLR236C 324 nt11.06□□□□□ -0.64
HER1Q12276 FPS1YLL043W 2010 nt11.05□□□□□ -0.64
HER1Q12276 BOR1YNL275W 1731 nt11.05□□□□□ -0.64
HER1Q12276 NCP1YHR042W 2076 nt11.05□□□□□ -0.64
HER1Q12276 YFL054CYFL054C 1941 nt11.03□□□□□ -0.64
HER1Q12276 YLR281CYLR281C 468 nt11.03□□□□□ -0.64
HER1Q12276 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.01□□□□□ -0.65
HER1Q12276 WHI5YOR083W 888 nt11.01□□□□□ -0.65
HER1Q12276 SPT8YLR055C 1809 nt10.96□□□□□ -0.65
HER1Q12276 PUS2YGL063W 1113 nt10.96□□□□□ -0.65
HER1Q12276 YJL152WYJL152W 360 nt10.91□□□□□ -0.66
HER1Q12276 LCB1YMR296C 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
HER1Q12276 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.84□□□□□ -0.67
HER1Q12276 UME6YDR207C 2511 nt10.81□□□□□ -0.68
HER1Q12276 IMP2'YIL154C 1041 nt10.78□□□□□ -0.68
HER1Q12276 DSK2YMR276W 1122 nt10.76□□□□□ -0.69
HER1Q12276 SWE1YJL187C 2460 nt10.75□□□□□ -0.69
HER1Q12276 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.74□□□□□ -0.69
HER1Q12276 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.74□□□□□ -0.69
HER1Q12276 HSP60YLR259C 1719 nt10.73□□□□□ -0.69
HER1Q12276 IDH1YNL037C 1083 nt10.72□□□□□ -0.69
HER1Q12276 YPR011CYPR011C 981 nt10.72□□□□□ -0.69
HER1Q12276 FMP45YDL222C 930 nt10.68□□□□□ -0.7
HER1Q12276 MRPL8YJL063C 717 nt10.66□□□□□ -0.7
HER1Q12276 GBP2YCL011C 1284 nt10.64□□□□□ -0.71
HER1Q12276 SIM1YIL123W 1431 nt10.63□□□□□ -0.71
HER1Q12276 MCH5YOR306C 1566 nt10.61□□□□□ -0.71
HER1Q12276 ALG12YNR030W 1656 nt10.61□□□□□ -0.71
HER1Q12276 LYS4YDR234W 2082 nt10.61□□□□□ -0.71
HER1Q12276 GLK1YCL040W 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
HER1Q12276 YDR433WYDR433W 441 nt10.57□□□□□ -0.72
HER1Q12276 FMP52YER004W 696 nt10.55□□□□□ -0.72
HER1Q12276 RRD1YIL153W 1182 nt10.55□□□□□ -0.72
HER1Q12276 ERV46YAL042W 1248 nt10.55□□□□□ -0.72
HER1Q12276 LPX1YOR084W 1164 nt10.54□□□□□ -0.72
HER1Q12276 PCM1YEL058W 1674 nt10.53□□□□□ -0.72
HER1Q12276 TCD2YKL027W 1344 nt10.53□□□□□ -0.72
HER1Q12276 YKR040CYKR040C 504 nt10.49□□□□□ -0.73
HER1Q12276 DED1YOR204W 1815 nt10.49□□□□□ -0.73
HER1Q12276 MXR2YCL033C 507 nt10.48□□□□□ -0.73
HER1Q12276 FUR4YBR021W 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
HER1Q12276 ADO1YJR105W 1023 nt10.47□□□□□ -0.73
HER1Q12276 BIO4YNR057C 714 nt10.47□□□□□ -0.73
HER1Q12276 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.43□□□□□ -0.74
HER1Q12276 YEL076CYEL076C 651 nt10.43□□□□□ -0.74
HER1Q12276 YLR464WYLR464W 651 nt10.43□□□□□ -0.74
HER1Q12276 UBX6YJL048C 1191 nt10.42□□□□□ -0.74
HER1Q12276 SNF6YHL025W 999 nt10.4□□□□□ -0.74
HER1Q12276 FMT1YBL013W 1206 nt10.4□□□□□ -0.74
HER1Q12276 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.39□□□□□ -0.75
HER1Q12276 ERF2YLR246W 1080 nt10.39□□□□□ -0.75
HER1Q12276 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
HER1Q12276 CWP1YKL096W 720 nt10.37□□□□□ -0.75
HER1Q12276 CRR1YLR213C 1269 nt10.37□□□□□ -0.75
HER1Q12276 AAC1YMR056C 930 nt10.37□□□□□ -0.75
HER1Q12276 ADH2YMR303C 1047 nt10.37□□□□□ -0.75
HER1Q12276 SPP1YPL138C 1062 nt10.37□□□□□ -0.75
HER1Q12276 RPM1RPM1 483 nt10.35□□□□□ -0.75
HER1Q12276 RTG1YOL067C 534 nt10.35□□□□□ -0.75
HER1Q12276 NAR1YNL240C 1476 nt10.34□□□□□ -0.75
HER1Q12276 CCA1YER168C 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
HER1Q12276 FRD1YEL047C 1413 nt10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.5 ms