Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
RBD2Q12270 PST2YDR032C 597 nt11.36□□□□□ -0.59
RBD2Q12270 GFD2YCL036W 1701 nt11.33□□□□□ -0.6
RBD2Q12270 ART5YGR068C 1761 nt11.31□□□□□ -0.6
RBD2Q12270 FPS1YLL043W 2010 nt11.3□□□□□ -0.6
RBD2Q12270 YSC84YHR016C 1407 nt11.28□□□□□ -0.6
RBD2Q12270 PIB2YGL023C 1908 nt11.26□□□□□ -0.61
RBD2Q12270 RTS2YOR077W 699 nt11.25□□□□□ -0.61
RBD2Q12270 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.24□□□□□ -0.61
RBD2Q12270 YHL050CYHL050C 2094 nt11.22□□□□□ -0.61
RBD2Q12270 PET9YBL030C 957 nt11.22□□□□□ -0.61
RBD2Q12270 YGR021WYGR021W 873 nt11.18□□□□□ -0.62
RBD2Q12270 CUE1YMR264W 612 nt11.16□□□□□ -0.62
RBD2Q12270 RTF1YGL244W 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 YCH1YGR203W 447 nt11.13□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 RRT12YCR045C 1476 nt11.12□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 HOM6YJR139C 1080 nt11.12□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 NVJ2YPR091C 2313 nt11.1□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 TIR4YOR009W 1464 nt11.1□□□□□ -0.63
RBD2Q12270 BOP3YNL042W 1191 nt11.05□□□□□ -0.64
RBD2Q12270 YNL195CYNL195C 786 nt11.05□□□□□ -0.64
RBD2Q12270 SHU1YHL006C 453 nt11.02□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 YMR057CYMR057C 372 nt11.02□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 YIL100WYIL100W 354 nt11.01□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 PTK1YKL198C 1989 nt10.99□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 MNP1YGL068W 585 nt10.98□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 RKM5YLR137W 1104 nt10.96□□□□□ -0.65
RBD2Q12270 YLR236CYLR236C 324 nt10.92□□□□□ -0.66
RBD2Q12270 NCP1YHR042W 2076 nt10.9□□□□□ -0.66
RBD2Q12270 NPL3YDR432W 1245 nt10.86□□□□□ -0.67
RBD2Q12270 YJL225CYJL225C 5277 nt10.82□□□□□ -0.68
RBD2Q12270 MOT3YMR070W 1473 nt10.76□□□□□ -0.69
RBD2Q12270 YJL152WYJL152W 360 nt10.76□□□□□ -0.69
RBD2Q12270 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.76□□□□□ -0.69
RBD2Q12270 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.75□□□□□ -0.69
RBD2Q12270 YFL054CYFL054C 1941 nt10.74□□□□□ -0.69
RBD2Q12270 LCB1YMR296C 1677 nt10.7□□□□□ -0.7
RBD2Q12270 SPT8YLR055C 1809 nt10.7□□□□□ -0.7
RBD2Q12270 YKL097CYKL097C 411 nt10.61□□□□□ -0.71
RBD2Q12270 BOR1YNL275W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
RBD2Q12270 YOL037CYOL037C 354 nt10.59□□□□□ -0.71
RBD2Q12270 RRD1YIL153W 1182 nt10.53□□□□□ -0.72
RBD2Q12270 FMP52YER004W 696 nt10.5□□□□□ -0.73
RBD2Q12270 SWE1YJL187C 2460 nt10.5□□□□□ -0.73
RBD2Q12270 LYS4YDR234W 2082 nt10.49□□□□□ -0.73
RBD2Q12270 SIM1YIL123W 1431 nt10.49□□□□□ -0.73
RBD2Q12270 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
RBD2Q12270 DED1YOR204W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 WHI5YOR083W 888 nt10.43□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 RPM1RPM1 483 nt10.42□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 IDH1YNL037C 1083 nt10.42□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 GBP2YCL011C 1284 nt10.41□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 HSP60YLR259C 1719 nt10.4□□□□□ -0.74
RBD2Q12270 UME6YDR207C 2511 nt10.38□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 YLR281CYLR281C 468 nt10.38□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 FMT1YBL013W 1206 nt10.38□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 BIO4YNR057C 714 nt10.38□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 TCD2YKL027W 1344 nt10.37□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.36□□□□□ -0.75
RBD2Q12270 ADH2YMR303C 1047 nt10.33□□□□□ -0.76
RBD2Q12270 SNF6YHL025W 999 nt10.32□□□□□ -0.76
RBD2Q12270 CWP1YKL096W 720 nt10.31□□□□□ -0.76
RBD2Q12270 YOR139CYOR139C 393 nt10.3□□□□□ -0.76
RBD2Q12270 GLK1YCL040W 1503 nt10.28□□□□□ -0.76
RBD2Q12270 ERF2YLR246W 1080 nt10.27□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 CRR1YLR213C 1269 nt10.26□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 ALG12YNR030W 1656 nt10.24□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.23□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 SOR2YDL246C 1074 nt10.22□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 SOR1YJR159W 1074 nt10.22□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 IMP2'YIL154C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
RBD2Q12270 FUR4YBR021W 1902 nt10.21□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 YIH1YCR059C 777 nt10.19□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 MCH5YOR306C 1566 nt10.17□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 YDR433WYDR433W 441 nt10.16□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 DSK2YMR276W 1122 nt10.16□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 MXR2YCL033C 507 nt10.16□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 HEM12YDR047W 1089 nt10.15□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 YLL053CYLL053C 459 nt10.15□□□□□ -0.78
RBD2Q12270 YCL042WYCL042W 360 nt10.14□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 MIC10YCL057C-A 294 nt10.14□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 CCA1YER168C 1641 nt10.14□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 RNQ1YCL028W 1218 nt10.13□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 RAX1YOR301W 1308 nt10.12□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 ATF2YGR177C 1608 nt10.12□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 FMP45YDL222C 930 nt10.12□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 SNG1YGR197C 1644 nt10.1□□□□□ -0.79
RBD2Q12270 PUS2YGL063W 1113 nt10.08□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 PRP4YPR178W 1398 nt10.07□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 YFL067WYFL067W 528 nt10.07□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.06□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 YEL076CYEL076C 651 nt10.06□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 YLR464WYLR464W 651 nt10.06□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 YPR011CYPR011C 981 nt10.06□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 FRD1YEL047C 1413 nt10.06□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 FTR1YER145C 1215 nt10.05□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 ERV46YAL042W 1248 nt10.03□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 AAC1YMR056C 930 nt10.03□□□□□ -0.8
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