Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YMR090WYMR090W 684 nt11.17□□□□□ -0.62
TY1A-BLQ12266 YBR220CYBR220C 1683 nt11.17□□□□□ -0.62
TY1A-BLQ12266 MNP1YGL068W 585 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-BLQ12266 CCT6YDR188W 1641 nt11.13□□□□□ -0.63
TY1A-BLQ12266 ALF1YNL148C 765 nt11.12□□□□□ -0.63
TY1A-BLQ12266 YDL221WYDL221W 552 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1A-BLQ12266 PTP1YDL230W 1008 nt11.07□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 RKM5YLR137W 1104 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 CAC2YML102W 1407 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 RPP2AYOL039W 321 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 SDH1YKL148C 1923 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 BUR6YER159C 429 nt11.03□□□□□ -0.64
TY1A-BLQ12266 SIS1YNL007C 1059 nt11.02□□□□□ -0.65
TY1A-BLQ12266 SUF2tP(AGG)C 72 nt11□□□□□ -0.65
TY1A-BLQ12266 SUF10tP(AGG)N 72 nt11□□□□□ -0.65
TY1A-BLQ12266 BMT5YIL096C 1011 nt10.97□□□□□ -0.65
TY1A-BLQ12266 YOR139CYOR139C 393 nt10.92□□□□□ -0.66
TY1A-BLQ12266 SCC4YER147C 1875 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1A-BLQ12266 IRC15YPL017C 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
TY1A-BLQ12266 Q0144Q0144 330 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 ART5YGR068C 1761 nt10.88□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 Q0010Q0010 387 nt10.86□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 PCH2YBR186W 1695 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 PAC11YDR488C 1602 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 GFD2YCL036W 1701 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 YOL037CYOL037C 354 nt10.85□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 SEC11YIR022W 504 nt10.84□□□□□ -0.67
TY1A-BLQ12266 GIS3YLR094C 1509 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1A-BLQ12266 GUT2YIL155C 1950 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1A-BLQ12266 TIR4YOR009W 1464 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1A-BLQ12266 NPL3YDR432W 1245 nt10.8□□□□□ -0.68
TY1A-BLQ12266 PET9YBL030C 957 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1A-BLQ12266 SEM1YDR363W-A 270 nt10.76□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 RTS2YOR077W 699 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.73□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.73□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 YCH1YGR203W 447 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 YSC84YHR016C 1407 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 SRN2YLR119W 642 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-BLQ12266 YMR057CYMR057C 372 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1A-BLQ12266 YJL152WYJL152W 360 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1A-BLQ12266 YLR281CYLR281C 468 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1A-BLQ12266 WHI5YOR083W 888 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1A-BLQ12266 ARA2YMR041C 1008 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1A-BLQ12266 PIB2YGL023C 1908 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1A-BLQ12266 YHL050CYHL050C 2094 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1A-BLQ12266 CUE1YMR264W 612 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1A-BLQ12266 FPS1YLL043W 2010 nt10.6□□□□□ -0.71
TY1A-BLQ12266 RTF1YGL244W 1677 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1A-BLQ12266 RRT12YCR045C 1476 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1A-BLQ12266 NVJ2YPR091C 2313 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 YNL195CYNL195C 786 nt10.5□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 YIL100WYIL100W 354 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 PUS2YGL063W 1113 nt10.48□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 ARP10YDR106W 855 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 BOP3YNL042W 1191 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1A-BLQ12266 YLR122CYLR122C 378 nt10.45□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 YLR236CYLR236C 324 nt10.45□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 ABZ2YMR289W 1125 nt10.44□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 YPR011CYPR011C 981 nt10.43□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 IDH1YNL037C 1083 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 Q0142Q0142 177 nt10.4□□□□□ -0.74
TY1A-BLQ12266 PTK1YKL198C 1989 nt10.39□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 DSK2YMR276W 1122 nt10.39□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 GBP2YCL011C 1284 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 RRD1YIL153W 1182 nt10.36□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 YCR099CYCR099C 468 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 IMP2'YIL154C 1041 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1A-BLQ12266 DED1YOR204W 1815 nt10.32□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 NCP1YHR042W 2076 nt10.32□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 AI3Q0060 1248 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 PET20YPL159C 762 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 MET8YBR213W 825 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 YJL225CYJL225C 5277 nt10.27□□□□□ -0.76
TY1A-BLQ12266 FMP45YDL222C 930 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 TCD2YKL027W 1344 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 YDR433WYDR433W 441 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 FMT1YBL013W 1206 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 MXR2YCL033C 507 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 Q0017Q0017 162 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 LPX1YOR084W 1164 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 ERV46YAL042W 1248 nt10.21□□□□□ -0.77
TY1A-BLQ12266 UTP6YDR449C 1323 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 CLB6YGR109C 1143 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 FMP52YER004W 696 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 YFL054CYFL054C 1941 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 TOM20YGR082W 552 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 LCB1YMR296C 1677 nt10.16□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 YKR040CYKR040C 504 nt10.15□□□□□ -0.78
TY1A-BLQ12266 PCM1YEL058W 1674 nt10.14□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 SPT8YLR055C 1809 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 snR78snR78 87 nt10.13□□□□□ -0.79
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