Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YDL221WYDL221W 552 nt10.59□□□□□ -0.71
USB1Q12208 YCH1YGR203W 447 nt10.57□□□□□ -0.72
USB1Q12208 ART5YGR068C 1761 nt10.55□□□□□ -0.72
USB1Q12208 PET9YBL030C 957 nt10.55□□□□□ -0.72
USB1Q12208 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.52□□□□□ -0.73
USB1Q12208 GFD2YCL036W 1701 nt10.51□□□□□ -0.73
USB1Q12208 FPS1YLL043W 2010 nt10.48□□□□□ -0.73
USB1Q12208 YJL152WYJL152W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
USB1Q12208 TIR4YOR009W 1464 nt10.48□□□□□ -0.73
USB1Q12208 YBR220CYBR220C 1683 nt10.47□□□□□ -0.73
USB1Q12208 SDH1YKL148C 1923 nt10.47□□□□□ -0.73
USB1Q12208 YLR281CYLR281C 468 nt10.45□□□□□ -0.74
USB1Q12208 WHI5YOR083W 888 nt10.45□□□□□ -0.74
USB1Q12208 IRC15YPL017C 1500 nt10.44□□□□□ -0.74
USB1Q12208 SCC4YER147C 1875 nt10.4□□□□□ -0.74
USB1Q12208 YMR057CYMR057C 372 nt10.4□□□□□ -0.74
USB1Q12208 GIS3YLR094C 1509 nt10.39□□□□□ -0.75
USB1Q12208 RTS2YOR077W 699 nt10.39□□□□□ -0.75
USB1Q12208 BDF1YLR399C 2061 nt10.38□□□□□ -0.75
USB1Q12208 CUE1YMR264W 612 nt10.34□□□□□ -0.75
USB1Q12208 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.34□□□□□ -0.75
USB1Q12208 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.33□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.33□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.33□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.33□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.33□□□□□ -0.76
USB1Q12208 PUS2YGL063W 1113 nt10.32□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IMP2'YIL154C 1041 nt10.32□□□□□ -0.76
USB1Q12208 NVJ2YPR091C 2313 nt10.31□□□□□ -0.76
USB1Q12208 YIL100WYIL100W 354 nt10.28□□□□□ -0.76
USB1Q12208 YLR236CYLR236C 324 nt10.28□□□□□ -0.76
USB1Q12208 IDH1YNL037C 1083 nt10.28□□□□□ -0.76
USB1Q12208 TAT1YBR069C 1860 nt10.27□□□□□ -0.77
USB1Q12208 DSK2YMR276W 1122 nt10.23□□□□□ -0.77
USB1Q12208 SEC11YIR022W 504 nt10.21□□□□□ -0.77
USB1Q12208 YNL195CYNL195C 786 nt10.21□□□□□ -0.77
USB1Q12208 GBP2YCL011C 1284 nt10.18□□□□□ -0.78
USB1Q12208 YJL225CYJL225C 5277 nt10.14□□□□□ -0.79
USB1Q12208 YSC84YHR016C 1407 nt10.14□□□□□ -0.79
USB1Q12208 PAC11YDR488C 1602 nt10.13□□□□□ -0.79
USB1Q12208 TCD2YKL027W 1344 nt10.11□□□□□ -0.79
USB1Q12208 PCH2YBR186W 1695 nt10.09□□□□□ -0.79
USB1Q12208 YDR433WYDR433W 441 nt10.09□□□□□ -0.79
USB1Q12208 RRT12YCR045C 1476 nt10.06□□□□□ -0.8
USB1Q12208 FMP45YDL222C 930 nt10.05□□□□□ -0.8
USB1Q12208 YHL050CYHL050C 2094 nt10.05□□□□□ -0.8
USB1Q12208 Q0182Q0182 405 nt10.04□□□□□ -0.8
USB1Q12208 YPR011CYPR011C 981 nt10.04□□□□□ -0.8
USB1Q12208 RRD1YIL153W 1182 nt10.03□□□□□ -0.8
USB1Q12208 FMP52YER004W 696 nt10.02□□□□□ -0.81
USB1Q12208 GUT2YIL155C 1950 nt10.02□□□□□ -0.81
USB1Q12208 ERV46YAL042W 1248 nt10.01□□□□□ -0.81
USB1Q12208 YKR040CYKR040C 504 nt9.98□□□□□ -0.81
USB1Q12208 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.97□□□□□ -0.81
USB1Q12208 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.97□□□□□ -0.81
USB1Q12208 DED1YOR204W 1815 nt9.97□□□□□ -0.81
USB1Q12208 LPX1YOR084W 1164 nt9.95□□□□□ -0.82
USB1Q12208 MOT3YMR070W 1473 nt9.95□□□□□ -0.82
USB1Q12208 MXR2YCL033C 507 nt9.94□□□□□ -0.82
USB1Q12208 YCL042WYCL042W 360 nt9.92□□□□□ -0.82
USB1Q12208 BOP3YNL042W 1191 nt9.89□□□□□ -0.83
USB1Q12208 RTF1YGL244W 1677 nt9.88□□□□□ -0.83
USB1Q12208 FMT1YBL013W 1206 nt9.88□□□□□ -0.83
USB1Q12208 PCM1YEL058W 1674 nt9.87□□□□□ -0.83
USB1Q12208 SOR2YDL246C 1074 nt9.86□□□□□ -0.83
USB1Q12208 SOR1YJR159W 1074 nt9.86□□□□□ -0.83
USB1Q12208 CWP1YKL096W 720 nt9.86□□□□□ -0.83
USB1Q12208 SNF6YHL025W 999 nt9.84□□□□□ -0.83
USB1Q12208 ADH2YMR303C 1047 nt9.82□□□□□ -0.84
USB1Q12208 FRD1YEL047C 1413 nt9.8□□□□□ -0.84
USB1Q12208 PIB2YGL023C 1908 nt9.8□□□□□ -0.84
USB1Q12208 SIM1YIL123W 1431 nt9.79□□□□□ -0.84
USB1Q12208 LCB1YMR296C 1677 nt9.76□□□□□ -0.85
USB1Q12208 NCP1YHR042W 2076 nt9.76□□□□□ -0.85
USB1Q12208 BIO4YNR057C 714 nt9.7□□□□□ -0.86
USB1Q12208 YIH1YCR059C 777 nt9.69□□□□□ -0.86
USB1Q12208 MRPL8YJL063C 717 nt9.69□□□□□ -0.86
USB1Q12208 RNQ1YCL028W 1218 nt9.69□□□□□ -0.86
USB1Q12208 PTK1YKL198C 1989 nt9.67□□□□□ -0.86
USB1Q12208 SPP1YPL138C 1062 nt9.67□□□□□ -0.86
USB1Q12208 YLR235CYLR235C 399 nt9.66□□□□□ -0.86
USB1Q12208 DIC1YLR348C 897 nt9.64□□□□□ -0.87
USB1Q12208 ERF2YLR246W 1080 nt9.63□□□□□ -0.87
USB1Q12208 YLL053CYLL053C 459 nt9.62□□□□□ -0.87
USB1Q12208 PTH1YHR189W 573 nt9.6□□□□□ -0.87
USB1Q12208 YFL054CYFL054C 1941 nt9.56□□□□□ -0.88
USB1Q12208 ADO1YJR105W 1023 nt9.56□□□□□ -0.88
USB1Q12208 FTR1YER145C 1215 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 YFL067WYFL067W 528 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 YKL030WYKL030W 606 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 CRR1YLR213C 1269 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 TIM23YNR017W 669 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 RTG1YOL067C 534 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 LYS4YDR234W 2082 nt9.55□□□□□ -0.88
USB1Q12208 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.54□□□□□ -0.88
USB1Q12208 YEL076CYEL076C 651 nt9.54□□□□□ -0.88
USB1Q12208 YLR464WYLR464W 651 nt9.54□□□□□ -0.88
USB1Q12208 AQY1YPR192W 918 nt9.54□□□□□ -0.88
USB1Q12208 GAL1YBR020W 1587 nt9.51□□□□□ -0.89
USB1Q12208 YLR179CYLR179C 606 nt9.51□□□□□ -0.89
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