Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 ART5YGR068C 1761 nt12.11□□□□□ -0.47
UPC2Q12151 TIR4YOR009W 1464 nt12.11□□□□□ -0.47
UPC2Q12151 YLR281CYLR281C 468 nt12.11□□□□□ -0.47
UPC2Q12151 GFD2YCL036W 1701 nt12.08□□□□□ -0.47
UPC2Q12151 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.08□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 WHI5YOR083W 888 nt12.08□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 YCH1YGR203W 447 nt12.05□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 MOT3YMR070W 1473 nt12.04□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 IRC15YPL017C 1500 nt12.03□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
UPC2Q12151 PET9YBL030C 957 nt11.97□□□□□ -0.49
UPC2Q12151 YBR220CYBR220C 1683 nt11.96□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 PUS2YGL063W 1113 nt11.95□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 RTS2YOR077W 699 nt11.95□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 YJL152WYJL152W 360 nt11.94□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 YMR057CYMR057C 372 nt11.94□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 YPR011CYPR011C 981 nt11.92□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 SDH1YKL148C 1923 nt11.91□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
UPC2Q12151 BDF1YLR399C 2061 nt11.9□□□□□ -0.51
UPC2Q12151 YMR090WYMR090W 684 nt11.89□□□□□ -0.51
UPC2Q12151 YLR236CYLR236C 324 nt11.88□□□□□ -0.51
UPC2Q12151 FPS1YLL043W 2010 nt11.84□□□□□ -0.51
UPC2Q12151 SCC4YER147C 1875 nt11.82□□□□□ -0.52
UPC2Q12151 DSK2YMR276W 1122 nt11.79□□□□□ -0.52
UPC2Q12151 CUE1YMR264W 612 nt11.78□□□□□ -0.52
UPC2Q12151 TAT1YBR069C 1860 nt11.72□□□□□ -0.53
UPC2Q12151 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.7□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 IMP2'YIL154C 1041 nt11.69□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 IDH1YNL037C 1083 nt11.69□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 FMP45YDL222C 930 nt11.66□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 GBP2YCL011C 1284 nt11.66□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 LPX1YOR084W 1164 nt11.65□□□□□ -0.54
UPC2Q12151 DED1YOR204W 1815 nt11.63□□□□□ -0.55
UPC2Q12151 RRD1YIL153W 1182 nt11.63□□□□□ -0.55
UPC2Q12151 ERV46YAL042W 1248 nt11.61□□□□□ -0.55
UPC2Q12151 MXR2YCL033C 507 nt11.61□□□□□ -0.55
UPC2Q12151 YDR433WYDR433W 441 nt11.57□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 RRT12YCR045C 1476 nt11.57□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 YHL050CYHL050C 2094 nt11.56□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 YSC84YHR016C 1407 nt11.56□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 YIL100WYIL100W 354 nt11.55□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 FMT1YBL013W 1206 nt11.54□□□□□ -0.56
UPC2Q12151 TCD2YKL027W 1344 nt11.5□□□□□ -0.57
UPC2Q12151 YKR040CYKR040C 504 nt11.48□□□□□ -0.57
UPC2Q12151 SPP1YPL138C 1062 nt11.47□□□□□ -0.57
UPC2Q12151 PCH2YBR186W 1695 nt11.43□□□□□ -0.58
UPC2Q12151 FRD1YEL047C 1413 nt11.41□□□□□ -0.58
UPC2Q12151 SEC11YIR022W 504 nt11.4□□□□□ -0.58
UPC2Q12151 GUT2YIL155C 1950 nt11.39□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 SOR2YDL246C 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 SOR1YJR159W 1074 nt11.37□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 YNL195CYNL195C 786 nt11.37□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 FMP52YER004W 696 nt11.36□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 ADH2YMR303C 1047 nt11.35□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 PIB2YGL023C 1908 nt11.35□□□□□ -0.59
UPC2Q12151 CWP1YKL096W 720 nt11.32□□□□□ -0.6
UPC2Q12151 PCM1YEL058W 1674 nt11.31□□□□□ -0.6
UPC2Q12151 YCL042WYCL042W 360 nt11.26□□□□□ -0.61
UPC2Q12151 NCP1YHR042W 2076 nt11.26□□□□□ -0.61
UPC2Q12151 LCB1YMR296C 1677 nt11.25□□□□□ -0.61
UPC2Q12151 SNF6YHL025W 999 nt11.19□□□□□ -0.62
UPC2Q12151 RTG1YOL067C 534 nt11.19□□□□□ -0.62
UPC2Q12151 PTH1YHR189W 573 nt11.18□□□□□ -0.62
UPC2Q12151 RTF1YGL244W 1677 nt11.17□□□□□ -0.62
UPC2Q12151 BIO4YNR057C 714 nt11.15□□□□□ -0.62
UPC2Q12151 SIM1YIL123W 1431 nt11.12□□□□□ -0.63
UPC2Q12151 YIH1YCR059C 777 nt11.12□□□□□ -0.63
UPC2Q12151 BOP3YNL042W 1191 nt11.1□□□□□ -0.63
UPC2Q12151 PTK1YKL198C 1989 nt11.09□□□□□ -0.63
UPC2Q12151 DIC1YLR348C 897 nt11.08□□□□□ -0.64
UPC2Q12151 RNQ1YCL028W 1218 nt11.08□□□□□ -0.64
UPC2Q12151 YLL053CYLL053C 459 nt11.05□□□□□ -0.64
UPC2Q12151 LYS4YDR234W 2082 nt11.04□□□□□ -0.64
UPC2Q12151 YLR235CYLR235C 399 nt11.02□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 YEL076CYEL076C 651 nt11□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 YLR464WYLR464W 651 nt11□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 PAC11YDR488C 1602 nt10.98□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 YKL030WYKL030W 606 nt10.97□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 MRPL8YJL063C 717 nt10.96□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 TIM23YNR017W 669 nt10.96□□□□□ -0.65
UPC2Q12151 FTR1YER145C 1215 nt10.95□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 ATF2YGR177C 1608 nt10.95□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 GAL1YBR020W 1587 nt10.93□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 CRR1YLR213C 1269 nt10.92□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 TRM5YHR070W 1500 nt10.91□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 WSC2YNL283C 1512 nt10.91□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 YLR179CYLR179C 606 nt10.9□□□□□ -0.66
UPC2Q12151 ERF2YLR246W 1080 nt10.89□□□□□ -0.67
UPC2Q12151 MIC10YCL057C-A 294 nt10.87□□□□□ -0.67
UPC2Q12151 AHT1YHR093W 549 nt10.85□□□□□ -0.67
UPC2Q12151 ADO1YJR105W 1023 nt10.83□□□□□ -0.68
UPC2Q12151 SNG1YGR197C 1644 nt10.81□□□□□ -0.68
UPC2Q12151 HUA1YGR268C 597 nt10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms