Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YMR090WYMR090W 684 nt11.79□□□□□ -0.52
NMD4Q12129 CAC2YML102W 1407 nt11.77□□□□□ -0.52
NMD4Q12129 BDF1YLR399C 2061 nt11.74□□□□□ -0.53
NMD4Q12129 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.74□□□□□ -0.53
NMD4Q12129 ART5YGR068C 1761 nt11.74□□□□□ -0.53
NMD4Q12129 YDL221WYDL221W 552 nt11.71□□□□□ -0.53
NMD4Q12129 YJL152WYJL152W 360 nt11.7□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 YLR281CYLR281C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 WHI5YOR083W 888 nt11.7□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 YCH1YGR203W 447 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 PET9YBL030C 957 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 GFD2YCL036W 1701 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 TIR4YOR009W 1464 nt11.68□□□□□ -0.54
NMD4Q12129 IRC15YPL017C 1500 nt11.6□□□□□ -0.55
NMD4Q12129 YMR057CYMR057C 372 nt11.59□□□□□ -0.55
NMD4Q12129 PUS2YGL063W 1113 nt11.58□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 YBR220CYBR220C 1683 nt11.58□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 SDH1YKL148C 1923 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 RTS2YOR077W 699 nt11.57□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 TAT1YBR069C 1860 nt11.55□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 GIS3YLR094C 1509 nt11.53□□□□□ -0.56
NMD4Q12129 SCC4YER147C 1875 nt11.51□□□□□ -0.57
NMD4Q12129 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.49□□□□□ -0.57
NMD4Q12129 IMP2'YIL154C 1041 nt11.47□□□□□ -0.57
NMD4Q12129 CUE1YMR264W 612 nt11.46□□□□□ -0.57
NMD4Q12129 IDH1YNL037C 1083 nt11.45□□□□□ -0.58
NMD4Q12129 DSK2YMR276W 1122 nt11.44□□□□□ -0.58
NMD4Q12129 FPS1YLL043W 2010 nt11.41□□□□□ -0.58
NMD4Q12129 YLR236CYLR236C 324 nt11.38□□□□□ -0.59
NMD4Q12129 YIL100WYIL100W 354 nt11.37□□□□□ -0.59
NMD4Q12129 PAC11YDR488C 1602 nt11.36□□□□□ -0.59
NMD4Q12129 GBP2YCL011C 1284 nt11.36□□□□□ -0.59
NMD4Q12129 YPR011CYPR011C 981 nt11.32□□□□□ -0.6
NMD4Q12129 FMP45YDL222C 930 nt11.28□□□□□ -0.6
NMD4Q12129 YDR433WYDR433W 441 nt11.28□□□□□ -0.6
NMD4Q12129 YNL195CYNL195C 786 nt11.27□□□□□ -0.61
NMD4Q12129 TCD2YKL027W 1344 nt11.25□□□□□ -0.61
NMD4Q12129 YSC84YHR016C 1407 nt11.22□□□□□ -0.61
NMD4Q12129 SEC11YIR022W 504 nt11.21□□□□□ -0.61
NMD4Q12129 RRD1YIL153W 1182 nt11.19□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 ERV46YAL042W 1248 nt11.19□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 LPX1YOR084W 1164 nt11.19□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 RRT12YCR045C 1476 nt11.18□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 MXR2YCL033C 507 nt11.16□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 YKR040CYKR040C 504 nt11.15□□□□□ -0.62
NMD4Q12129 YHL050CYHL050C 2094 nt11.15□□□□□ -0.63
NMD4Q12129 DED1YOR204W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
NMD4Q12129 PCH2YBR186W 1695 nt11.12□□□□□ -0.63
NMD4Q12129 FMP52YER004W 696 nt11.1□□□□□ -0.63
NMD4Q12129 NVJ2YPR091C 2313 nt11.1□□□□□ -0.63
NMD4Q12129 FMT1YBL013W 1206 nt11.05□□□□□ -0.64
NMD4Q12129 GUT2YIL155C 1950 nt11.05□□□□□ -0.64
NMD4Q12129 YCL042WYCL042W 360 nt11.04□□□□□ -0.64
NMD4Q12129 CWP1YKL096W 720 nt11□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 PCM1YEL058W 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 SOR2YDL246C 1074 nt10.97□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 SOR1YJR159W 1074 nt10.97□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 ADH2YMR303C 1047 nt10.97□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 FRD1YEL047C 1413 nt10.96□□□□□ -0.65
NMD4Q12129 SNF6YHL025W 999 nt10.93□□□□□ -0.66
NMD4Q12129 SPP1YPL138C 1062 nt10.92□□□□□ -0.66
NMD4Q12129 RTF1YGL244W 1677 nt10.89□□□□□ -0.67
NMD4Q12129 BOP3YNL042W 1191 nt10.89□□□□□ -0.67
NMD4Q12129 SIM1YIL123W 1431 nt10.87□□□□□ -0.67
NMD4Q12129 LCB1YMR296C 1677 nt10.84□□□□□ -0.67
NMD4Q12129 PIB2YGL023C 1908 nt10.84□□□□□ -0.67
NMD4Q12129 NCP1YHR042W 2076 nt10.8□□□□□ -0.68
NMD4Q12129 PTH1YHR189W 573 nt10.79□□□□□ -0.68
NMD4Q12129 BIO4YNR057C 714 nt10.78□□□□□ -0.68
NMD4Q12129 YIH1YCR059C 777 nt10.77□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 RNQ1YCL028W 1218 nt10.77□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 YLR235CYLR235C 399 nt10.76□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 YJL225CYJL225C 5277 nt10.75□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 DIC1YLR348C 897 nt10.74□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 YLL053CYLL053C 459 nt10.71□□□□□ -0.69
NMD4Q12129 PTK1YKL198C 1989 nt10.69□□□□□ -0.7
NMD4Q12129 YKL030WYKL030W 606 nt10.67□□□□□ -0.7
NMD4Q12129 ERF2YLR246W 1080 nt10.65□□□□□ -0.7
NMD4Q12129 TIM23YNR017W 669 nt10.65□□□□□ -0.7
NMD4Q12129 RTG1YOL067C 534 nt10.65□□□□□ -0.7
NMD4Q12129 FTR1YER145C 1215 nt10.63□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 YLR179CYLR179C 606 nt10.62□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 YEL076CYEL076C 651 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 MRPL8YJL063C 717 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 YLR464WYLR464W 651 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 LYS4YDR234W 2082 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 GAL1YBR020W 1587 nt10.59□□□□□ -0.71
NMD4Q12129 CRR1YLR213C 1269 nt10.58□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 TRM5YHR070W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 YFL067WYFL067W 528 nt10.57□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 YFL054CYFL054C 1941 nt10.56□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 ATF2YGR177C 1608 nt10.56□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 ADO1YJR105W 1023 nt10.56□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 DDR2YOL052C-A 186 nt10.56□□□□□ -0.72
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