Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 IMP2'YIL154C 1041 nt11.25□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YDR095CYDR095C 411 nt11.24□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.24□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YCH1YGR203W 447 nt11.23□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 TRM9YML014W 840 nt11.22□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YPR011CYPR011C 981 nt11.21□□□□□ -0.61
TMS1Q12116 YBR220CYBR220C 1683 nt11.2□□□□□ -0.62
TMS1Q12116 EMI2YDR516C 1503 nt11.19□□□□□ -0.62
TMS1Q12116 YLR236CYLR236C 324 nt11.17□□□□□ -0.62
TMS1Q12116 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.13□□□□□ -0.63
TMS1Q12116 FUN26YAL022C 1554 nt11.12□□□□□ -0.63
TMS1Q12116 ADO1YJR105W 1023 nt11.12□□□□□ -0.63
TMS1Q12116 YMR090WYMR090W 684 nt11.09□□□□□ -0.63
TMS1Q12116 YDL221WYDL221W 552 nt11.08□□□□□ -0.64
TMS1Q12116 PTP1YDL230W 1008 nt11.07□□□□□ -0.64
TMS1Q12116 CAC2YML102W 1407 nt11.07□□□□□ -0.64
TMS1Q12116 CCT6YDR188W 1641 nt11.06□□□□□ -0.64
TMS1Q12116 SDH1YKL148C 1923 nt11.05□□□□□ -0.64
TMS1Q12116 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.02□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 YEL076CYEL076C 651 nt11.02□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 YLR464WYLR464W 651 nt11.02□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 UBX6YJL048C 1191 nt11□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 RPP2AYOL039W 321 nt11□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.97□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.97□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 LPX1YOR084W 1164 nt10.97□□□□□ -0.65
TMS1Q12116 ERV46YAL042W 1248 nt10.95□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 YJL152WYJL152W 360 nt10.94□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 ALF1YNL148C 765 nt10.94□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 PAC11YDR488C 1602 nt10.92□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 SPP1YPL138C 1062 nt10.92□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 SIS1YNL007C 1059 nt10.91□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 IDH1YNL037C 1083 nt10.91□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 RTG1YOL067C 534 nt10.91□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 IRC15YPL017C 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
TMS1Q12116 SCC4YER147C 1875 nt10.89□□□□□ -0.67
TMS1Q12116 PCH2YBR186W 1695 nt10.88□□□□□ -0.67
TMS1Q12116 GUT2YIL155C 1950 nt10.85□□□□□ -0.67
TMS1Q12116 YDR433WYDR433W 441 nt10.85□□□□□ -0.67
TMS1Q12116 YKR040CYKR040C 504 nt10.83□□□□□ -0.68
TMS1Q12116 GIS3YLR094C 1509 nt10.83□□□□□ -0.68
TMS1Q12116 SEC11YIR022W 504 nt10.8□□□□□ -0.68
TMS1Q12116 GFD2YCL036W 1701 nt10.76□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 HUA1YGR268C 597 nt10.76□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 PIB2YGL023C 1908 nt10.74□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 GBP2YCL011C 1284 nt10.74□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 ART5YGR068C 1761 nt10.74□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 YDR094WYDR094W 336 nt10.73□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 YSC84YHR016C 1407 nt10.71□□□□□ -0.69
TMS1Q12116 RTS2YOR077W 699 nt10.68□□□□□ -0.7
TMS1Q12116 MXR2YCL033C 507 nt10.68□□□□□ -0.7
TMS1Q12116 YHL050CYHL050C 2094 nt10.67□□□□□ -0.7
TMS1Q12116 TIR4YOR009W 1464 nt10.65□□□□□ -0.7
TMS1Q12116 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.64□□□□□ -0.71
TMS1Q12116 FPS1YLL043W 2010 nt10.63□□□□□ -0.71
TMS1Q12116 PET9YBL030C 957 nt10.61□□□□□ -0.71
TMS1Q12116 NVJ2YPR091C 2313 nt10.58□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 RRT12YCR045C 1476 nt10.57□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 CUE1YMR264W 612 nt10.57□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 RTF1YGL244W 1677 nt10.57□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 Q0182Q0182 405 nt10.56□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 TCD2YKL027W 1344 nt10.56□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.55□□□□□ -0.72
TMS1Q12116 YMR057CYMR057C 372 nt10.5□□□□□ -0.73
TMS1Q12116 PTK1YKL198C 1989 nt10.46□□□□□ -0.73
TMS1Q12116 FRD1YEL047C 1413 nt10.46□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 BOP3YNL042W 1191 nt10.45□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 YKL030WYKL030W 606 nt10.44□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 PTH1YHR189W 573 nt10.42□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 YLR235CYLR235C 399 nt10.41□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 YNL195CYNL195C 786 nt10.41□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 YIL100WYIL100W 354 nt10.4□□□□□ -0.74
TMS1Q12116 DED1YOR204W 1815 nt10.39□□□□□ -0.75
TMS1Q12116 YCL042WYCL042W 360 nt10.38□□□□□ -0.75
TMS1Q12116 NCP1YHR042W 2076 nt10.38□□□□□ -0.75
TMS1Q12116 RRD1YIL153W 1182 nt10.34□□□□□ -0.75
TMS1Q12116 SBA1YKL117W 651 nt10.34□□□□□ -0.75
TMS1Q12116 LCB1YMR296C 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
TMS1Q12116 SOR2YDL246C 1074 nt10.29□□□□□ -0.76
TMS1Q12116 SOR1YJR159W 1074 nt10.29□□□□□ -0.76
TMS1Q12116 PAU16YKL224C 372 nt10.29□□□□□ -0.76
TMS1Q12116 RRT5YFR032C 870 nt10.27□□□□□ -0.77
TMS1Q12116 YFR018CYFR018C 1092 nt10.25□□□□□ -0.77
TMS1Q12116 FMT1YBL013W 1206 nt10.24□□□□□ -0.77
TMS1Q12116 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.21□□□□□ -0.77
TMS1Q12116 YFL054CYFL054C 1941 nt10.18□□□□□ -0.78
TMS1Q12116 FMP52YER004W 696 nt10.16□□□□□ -0.78
TMS1Q12116 SPT8YLR055C 1809 nt10.16□□□□□ -0.78
TMS1Q12116 TIM23YNR017W 669 nt10.15□□□□□ -0.78
TMS1Q12116 PRE6YOL038W 765 nt10.14□□□□□ -0.79
TMS1Q12116 CWP1YKL096W 720 nt10.13□□□□□ -0.79
TMS1Q12116 DIC1YLR348C 897 nt10.09□□□□□ -0.79
TMS1Q12116 SNF6YHL025W 999 nt10.08□□□□□ -0.8
TMS1Q12116 YPR064WYPR064W 420 nt10.08□□□□□ -0.8
TMS1Q12116 YLR179CYLR179C 606 nt10.07□□□□□ -0.8
TMS1Q12116 ADH2YMR303C 1047 nt10.07□□□□□ -0.8
TMS1Q12116 BOR1YNL275W 1731 nt10.03□□□□□ -0.8
TMS1Q12116 TAD3YLR316C 969 nt10.02□□□□□ -0.81
TMS1Q12116 YJL225CYJL225C 5277 nt10.02□□□□□ -0.81
TMS1Q12116 NAT4YMR069W 858 nt10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms