Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 PUS2YGL063W 1113 nt12.21□□□□□ -0.45
SMF3Q12078 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
SMF3Q12078 MEP2YNL142W 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
SMF3Q12078 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.16□□□□□ -0.46
SMF3Q12078 SIS1YNL007C 1059 nt12.15□□□□□ -0.46
SMF3Q12078 MOT3YMR070W 1473 nt12.09□□□□□ -0.47
SMF3Q12078 RPP2AYOL039W 321 nt12.08□□□□□ -0.48
SMF3Q12078 PTP1YDL230W 1008 nt12.04□□□□□ -0.48
SMF3Q12078 YJL152WYJL152W 360 nt12.04□□□□□ -0.48
SMF3Q12078 TIR4YOR009W 1464 nt12.01□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 TAT1YBR069C 1860 nt12□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 DSK2YMR276W 1122 nt12□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 DCW1YKL046C 1350 nt12□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 YPR011CYPR011C 981 nt11.99□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 YLR236CYLR236C 324 nt11.98□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 YCH1YGR203W 447 nt11.97□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 ART5YGR068C 1761 nt11.97□□□□□ -0.49
SMF3Q12078 IMP2'YIL154C 1041 nt11.95□□□□□ -0.5
SMF3Q12078 CAC2YML102W 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
SMF3Q12078 FMP45YDL222C 930 nt11.91□□□□□ -0.5
SMF3Q12078 GFD2YCL036W 1701 nt11.9□□□□□ -0.5
SMF3Q12078 PET9YBL030C 957 nt11.89□□□□□ -0.51
SMF3Q12078 YMR057CYMR057C 372 nt11.86□□□□□ -0.51
SMF3Q12078 IDH1YNL037C 1083 nt11.85□□□□□ -0.51
SMF3Q12078 EMI2YDR516C 1503 nt11.84□□□□□ -0.51
SMF3Q12078 PAC11YDR488C 1602 nt11.78□□□□□ -0.52
SMF3Q12078 YDL221WYDL221W 552 nt11.77□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 LPX1YOR084W 1164 nt11.77□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 RTS2YOR077W 699 nt11.76□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 GBP2YCL011C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.75□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 YMR090WYMR090W 684 nt11.74□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 IRC15YPL017C 1500 nt11.74□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 YDR433WYDR433W 441 nt11.73□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 ERV46YAL042W 1248 nt11.73□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 YBR220CYBR220C 1683 nt11.72□□□□□ -0.53
SMF3Q12078 FPS1YLL043W 2010 nt11.68□□□□□ -0.54
SMF3Q12078 MXR2YCL033C 507 nt11.66□□□□□ -0.54
SMF3Q12078 GIS3YLR094C 1509 nt11.65□□□□□ -0.54
SMF3Q12078 YKR040CYKR040C 504 nt11.63□□□□□ -0.55
SMF3Q12078 CUE1YMR264W 612 nt11.63□□□□□ -0.55
SMF3Q12078 SPP1YPL138C 1062 nt11.6□□□□□ -0.55
SMF3Q12078 SDH1YKL148C 1923 nt11.6□□□□□ -0.55
SMF3Q12078 TCD2YKL027W 1344 nt11.6□□□□□ -0.55
SMF3Q12078 DED1YOR204W 1815 nt11.56□□□□□ -0.56
SMF3Q12078 SCC4YER147C 1875 nt11.55□□□□□ -0.56
SMF3Q12078 RRD1YIL153W 1182 nt11.55□□□□□ -0.56
SMF3Q12078 YIL100WYIL100W 354 nt11.48□□□□□ -0.57
SMF3Q12078 PCH2YBR186W 1695 nt11.46□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 FMT1YBL013W 1206 nt11.44□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 FRD1YEL047C 1413 nt11.43□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 SEC11YIR022W 504 nt11.43□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 GUT2YIL155C 1950 nt11.42□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 MRPL8YJL063C 717 nt11.4□□□□□ -0.58
SMF3Q12078 RTG1YOL067C 534 nt11.38□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 NVJ2YPR091C 2313 nt11.38□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 YCL042WYCL042W 360 nt11.37□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 SOR2YDL246C 1074 nt11.36□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 SOR1YJR159W 1074 nt11.36□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 FMP52YER004W 696 nt11.35□□□□□ -0.59
SMF3Q12078 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.33□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 YEL076CYEL076C 651 nt11.33□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 YLR464WYLR464W 651 nt11.33□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 CWP1YKL096W 720 nt11.31□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 ADH2YMR303C 1047 nt11.29□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 PTH1YHR189W 573 nt11.28□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 ADO1YJR105W 1023 nt11.28□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 YNL195CYNL195C 786 nt11.28□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 RRT12YCR045C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
SMF3Q12078 YSC84YHR016C 1407 nt11.26□□□□□ -0.61
SMF3Q12078 PCM1YEL058W 1674 nt11.24□□□□□ -0.61
SMF3Q12078 YHL050CYHL050C 2094 nt11.21□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 PIB2YGL023C 1908 nt11.19□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 YLR235CYLR235C 399 nt11.19□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 SNF6YHL025W 999 nt11.18□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 YKL030WYKL030W 606 nt11.16□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 HUA1YGR268C 597 nt11.15□□□□□ -0.62
SMF3Q12078 RTF1YGL244W 1677 nt11.12□□□□□ -0.63
SMF3Q12078 LCB1YMR296C 1677 nt11.12□□□□□ -0.63
SMF3Q12078 DIC1YLR348C 897 nt11.11□□□□□ -0.63
SMF3Q12078 YIH1YCR059C 777 nt11.06□□□□□ -0.64
SMF3Q12078 TIM23YNR017W 669 nt11.06□□□□□ -0.64
SMF3Q12078 RNQ1YCL028W 1218 nt11.06□□□□□ -0.64
SMF3Q12078 SIM1YIL123W 1431 nt11.02□□□□□ -0.64
SMF3Q12078 BOP3YNL042W 1191 nt11.02□□□□□ -0.65
SMF3Q12078 BIO4YNR057C 714 nt11.02□□□□□ -0.65
SMF3Q12078 UBX6YJL048C 1191 nt11□□□□□ -0.65
SMF3Q12078 YLR179CYLR179C 606 nt11□□□□□ -0.65
SMF3Q12078 YLL053CYLL053C 459 nt10.98□□□□□ -0.65
SMF3Q12078 PTK1YKL198C 1989 nt10.95□□□□□ -0.66
SMF3Q12078 FTR1YER145C 1215 nt10.91□□□□□ -0.66
SMF3Q12078 WSC2YNL283C 1512 nt10.9□□□□□ -0.66
SMF3Q12078 YDR094WYDR094W 336 nt10.9□□□□□ -0.66
SMF3Q12078 YPR064WYPR064W 420 nt10.9□□□□□ -0.66
SMF3Q12078 NCP1YHR042W 2076 nt10.89□□□□□ -0.67
SMF3Q12078 YJL225CYJL225C 5277 nt10.89□□□□□ -0.67
SMF3Q12078 GAL1YBR020W 1587 nt10.88□□□□□ -0.67
SMF3Q12078 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.87□□□□□ -0.67
SMF3Q12078 AHT1YHR093W 549 nt10.87□□□□□ -0.67
SMF3Q12078 RPM1RPM1 483 nt10.86□□□□□ -0.67
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