Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 MEP2YNL142W 1500 nt12.84□□□□□ -0.35
SPE3Q12074 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.83□□□□□ -0.36
SPE3Q12074 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.83□□□□□ -0.36
SPE3Q12074 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.82□□□□□ -0.36
SPE3Q12074 IMP2'YIL154C 1041 nt12.81□□□□□ -0.36
SPE3Q12074 SSA4YER103W 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
SPE3Q12074 YJL152WYJL152W 360 nt12.74□□□□□ -0.37
SPE3Q12074 YCH1YGR203W 447 nt12.72□□□□□ -0.37
SPE3Q12074 YLR236CYLR236C 324 nt12.72□□□□□ -0.37
SPE3Q12074 YPR011CYPR011C 981 nt12.7□□□□□ -0.38
SPE3Q12074 RPP2AYOL039W 321 nt12.67□□□□□ -0.38
SPE3Q12074 SIS1YNL007C 1059 nt12.66□□□□□ -0.38
SPE3Q12074 DCW1YKL046C 1350 nt12.6□□□□□ -0.39
SPE3Q12074 IDH1YNL037C 1083 nt12.59□□□□□ -0.39
SPE3Q12074 PTP1YDL230W 1008 nt12.55□□□□□ -0.4
SPE3Q12074 MRPL8YJL063C 717 nt12.53□□□□□ -0.4
SPE3Q12074 YDR433WYDR433W 441 nt12.52□□□□□ -0.41
SPE3Q12074 LPX1YOR084W 1164 nt12.52□□□□□ -0.41
SPE3Q12074 EMI2YDR516C 1503 nt12.49□□□□□ -0.41
SPE3Q12074 YMR090WYMR090W 684 nt12.49□□□□□ -0.41
SPE3Q12074 Q0182Q0182 405 nt12.47□□□□□ -0.41
SPE3Q12074 CAC2YML102W 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 ERV46YAL042W 1248 nt12.45□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 ART5YGR068C 1761 nt12.44□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 ADO1YJR105W 1023 nt12.43□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 PET9YBL030C 957 nt12.43□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 GBP2YCL011C 1284 nt12.42□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 TIR4YOR009W 1464 nt12.4□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 YDL221WYDL221W 552 nt12.4□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 SPP1YPL138C 1062 nt12.4□□□□□ -0.42
SPE3Q12074 GFD2YCL036W 1701 nt12.4□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 BDF1YLR399C 2061 nt12.38□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YKR040CYKR040C 504 nt12.36□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.35□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YEL076CYEL076C 651 nt12.35□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YLR464WYLR464W 651 nt12.35□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.34□□□□□ -0.43
SPE3Q12074 YMR057CYMR057C 372 nt12.3□□□□□ -0.44
SPE3Q12074 MXR2YCL033C 507 nt12.29□□□□□ -0.44
SPE3Q12074 IRC15YPL017C 1500 nt12.27□□□□□ -0.44
SPE3Q12074 RTS2YOR077W 699 nt12.25□□□□□ -0.45
SPE3Q12074 SDH1YKL148C 1923 nt12.24□□□□□ -0.45
SPE3Q12074 YBR220CYBR220C 1683 nt12.23□□□□□ -0.45
SPE3Q12074 TCD2YKL027W 1344 nt12.23□□□□□ -0.45
SPE3Q12074 RTG1YOL067C 534 nt12.23□□□□□ -0.45
SPE3Q12074 GIS3YLR094C 1509 nt12.2□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 TAT1YBR069C 1860 nt12.19□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 UBX6YJL048C 1191 nt12.18□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 SCC4YER147C 1875 nt12.18□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 CUE1YMR264W 612 nt12.17□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 HUA1YGR268C 597 nt12.16□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 PAC11YDR488C 1602 nt12.15□□□□□ -0.46
SPE3Q12074 FPS1YLL043W 2010 nt12.11□□□□□ -0.47
SPE3Q12074 YIL100WYIL100W 354 nt12.07□□□□□ -0.48
SPE3Q12074 YCL042WYCL042W 360 nt12.04□□□□□ -0.48
SPE3Q12074 PTH1YHR189W 573 nt12□□□□□ -0.49
SPE3Q12074 FRD1YEL047C 1413 nt11.98□□□□□ -0.49
SPE3Q12074 DED1YOR204W 1815 nt11.95□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 YDR094WYDR094W 336 nt11.95□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 RRD1YIL153W 1182 nt11.95□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 YNL195CYNL195C 786 nt11.95□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 YLR235CYLR235C 399 nt11.93□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 YKL030WYKL030W 606 nt11.92□□□□□ -0.5
SPE3Q12074 SEC11YIR022W 504 nt11.88□□□□□ -0.51
SPE3Q12074 YSC84YHR016C 1407 nt11.86□□□□□ -0.51
SPE3Q12074 NVJ2YPR091C 2313 nt11.85□□□□□ -0.51
SPE3Q12074 SOR2YDL246C 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
SPE3Q12074 SOR1YJR159W 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
SPE3Q12074 FMP52YER004W 696 nt11.83□□□□□ -0.52
SPE3Q12074 CWP1YKL096W 720 nt11.81□□□□□ -0.52
SPE3Q12074 FMT1YBL013W 1206 nt11.81□□□□□ -0.52
SPE3Q12074 LCB1YMR296C 1677 nt11.81□□□□□ -0.52
SPE3Q12074 RRT12YCR045C 1476 nt11.8□□□□□ -0.52
SPE3Q12074 YHL050CYHL050C 2094 nt11.77□□□□□ -0.53
SPE3Q12074 PCH2YBR186W 1695 nt11.75□□□□□ -0.53
SPE3Q12074 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.71□□□□□ -0.53
SPE3Q12074 ADH2YMR303C 1047 nt11.7□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 TIM23YNR017W 669 nt11.68□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 PCM1YEL058W 1674 nt11.66□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 GUT2YIL155C 1950 nt11.66□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.65□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 SNF6YHL025W 999 nt11.65□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 DIC1YLR348C 897 nt11.65□□□□□ -0.54
SPE3Q12074 YLR179CYLR179C 606 nt11.63□□□□□ -0.55
SPE3Q12074 RRT5YFR032C 870 nt11.61□□□□□ -0.55
SPE3Q12074 PAU16YKL224C 372 nt11.58□□□□□ -0.56
SPE3Q12074 YPR064WYPR064W 420 nt11.58□□□□□ -0.56
SPE3Q12074 YFR018CYFR018C 1092 nt11.53□□□□□ -0.56
SPE3Q12074 BOP3YNL042W 1191 nt11.53□□□□□ -0.56
SPE3Q12074 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.56
SPE3Q12074 RTF1YGL244W 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
SPE3Q12074 RNQ1YCL028W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
SPE3Q12074 TAD3YLR316C 969 nt11.48□□□□□ -0.57
SPE3Q12074 YIH1YCR059C 777 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE3Q12074 BIO4YNR057C 714 nt11.46□□□□□ -0.57
SPE3Q12074 PRE6YOL038W 765 nt11.45□□□□□ -0.58
SPE3Q12074 YJL225CYJL225C 5277 nt11.44□□□□□ -0.58
SPE3Q12074 PIB2YGL023C 1908 nt11.42□□□□□ -0.58
SPE3Q12074 NCP1YHR042W 2076 nt11.42□□□□□ -0.58
SPE3Q12074 SBA1YKL117W 651 nt11.4□□□□□ -0.58
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