Protein–RNA interactions for Protein: Q12063

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUS1Q12063 ART5YGR068C 1761 nt12.18□□□□□ -0.46
NUS1Q12063 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.16□□□□□ -0.46
NUS1Q12063 YLR281CYLR281C 468 nt12.16□□□□□ -0.46
NUS1Q12063 TIR4YOR009W 1464 nt12.15□□□□□ -0.46
NUS1Q12063 YDL221WYDL221W 552 nt12.15□□□□□ -0.46
NUS1Q12063 GFD2YCL036W 1701 nt12.14□□□□□ -0.47
NUS1Q12063 WHI5YOR083W 888 nt12.14□□□□□ -0.47
NUS1Q12063 YMR090WYMR090W 684 nt12.13□□□□□ -0.47
NUS1Q12063 PET9YBL030C 957 nt12.1□□□□□ -0.47
NUS1Q12063 YCH1YGR203W 447 nt12.07□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 YJL152WYJL152W 360 nt12.07□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 IRC15YPL017C 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.05□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.05□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.05□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.05□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.05□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
NUS1Q12063 YMR057CYMR057C 372 nt12.01□□□□□ -0.49
NUS1Q12063 RTS2YOR077W 699 nt12.01□□□□□ -0.49
NUS1Q12063 SDH1YKL148C 1923 nt12.01□□□□□ -0.49
NUS1Q12063 PUS2YGL063W 1113 nt12□□□□□ -0.49
NUS1Q12063 GIS3YLR094C 1509 nt11.98□□□□□ -0.49
NUS1Q12063 SCC4YER147C 1875 nt11.92□□□□□ -0.5
NUS1Q12063 BDF1YLR399C 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
NUS1Q12063 MOT3YMR070W 1473 nt11.91□□□□□ -0.5
NUS1Q12063 CUE1YMR264W 612 nt11.89□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 FPS1YLL043W 2010 nt11.87□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 DSK2YMR276W 1122 nt11.87□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.86□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 IMP2'YIL154C 1041 nt11.85□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 YLR236CYLR236C 324 nt11.85□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 IDH1YNL037C 1083 nt11.84□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 YPR011CYPR011C 981 nt11.84□□□□□ -0.51
NUS1Q12063 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
NUS1Q12063 GBP2YCL011C 1284 nt11.76□□□□□ -0.53
NUS1Q12063 YIL100WYIL100W 354 nt11.73□□□□□ -0.53
NUS1Q12063 FMP45YDL222C 930 nt11.71□□□□□ -0.53
NUS1Q12063 YDR433WYDR433W 441 nt11.67□□□□□ -0.54
NUS1Q12063 RRD1YIL153W 1182 nt11.66□□□□□ -0.54
NUS1Q12063 LPX1YOR084W 1164 nt11.65□□□□□ -0.54
NUS1Q12063 TCD2YKL027W 1344 nt11.64□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 YSC84YHR016C 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 ERV46YAL042W 1248 nt11.64□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 DED1YOR204W 1815 nt11.62□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 MXR2YCL033C 507 nt11.61□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 RRT12YCR045C 1476 nt11.61□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 SEC11YIR022W 504 nt11.59□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 YNL195CYNL195C 786 nt11.59□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 YHL050CYHL050C 2094 nt11.59□□□□□ -0.55
NUS1Q12063 YKR040CYKR040C 504 nt11.56□□□□□ -0.56
NUS1Q12063 PCH2YBR186W 1695 nt11.53□□□□□ -0.56
NUS1Q12063 FMT1YBL013W 1206 nt11.52□□□□□ -0.57
NUS1Q12063 FMP52YER004W 696 nt11.5□□□□□ -0.57
NUS1Q12063 GUT2YIL155C 1950 nt11.47□□□□□ -0.57
NUS1Q12063 SOR2YDL246C 1074 nt11.43□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 SOR1YJR159W 1074 nt11.43□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 FRD1YEL047C 1413 nt11.42□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 CWP1YKL096W 720 nt11.4□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 SPP1YPL138C 1062 nt11.4□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 YCL042WYCL042W 360 nt11.4□□□□□ -0.58
NUS1Q12063 ADH2YMR303C 1047 nt11.39□□□□□ -0.59
NUS1Q12063 PCM1YEL058W 1674 nt11.39□□□□□ -0.59
NUS1Q12063 PIB2YGL023C 1908 nt11.32□□□□□ -0.6
NUS1Q12063 SNF6YHL025W 999 nt11.31□□□□□ -0.6
NUS1Q12063 RTF1YGL244W 1677 nt11.29□□□□□ -0.6
NUS1Q12063 LCB1YMR296C 1677 nt11.28□□□□□ -0.6
NUS1Q12063 NCP1YHR042W 2076 nt11.26□□□□□ -0.61
NUS1Q12063 BOP3YNL042W 1191 nt11.26□□□□□ -0.61
NUS1Q12063 SIM1YIL123W 1431 nt11.24□□□□□ -0.61
NUS1Q12063 BIO4YNR057C 714 nt11.21□□□□□ -0.61
NUS1Q12063 YIH1YCR059C 777 nt11.2□□□□□ -0.62
NUS1Q12063 PTH1YHR189W 573 nt11.2□□□□□ -0.62
NUS1Q12063 RNQ1YCL028W 1218 nt11.17□□□□□ -0.62
NUS1Q12063 DIC1YLR348C 897 nt11.15□□□□□ -0.62
NUS1Q12063 YLR235CYLR235C 399 nt11.14□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 RTG1YOL067C 534 nt11.13□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 PTK1YKL198C 1989 nt11.12□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 YLL053CYLL053C 459 nt11.12□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 PAC11YDR488C 1602 nt11.11□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 YJL225CYJL225C 5277 nt11.1□□□□□ -0.63
NUS1Q12063 YKL030WYKL030W 606 nt11.07□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 TIM23YNR017W 669 nt11.05□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 LYS4YDR234W 2082 nt11.04□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 YEL076CYEL076C 651 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 FTR1YER145C 1215 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 MRPL8YJL063C 717 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 ERF2YLR246W 1080 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 YLR464WYLR464W 651 nt11.03□□□□□ -0.64
NUS1Q12063 CRR1YLR213C 1269 nt11.01□□□□□ -0.65
NUS1Q12063 GAL1YBR020W 1587 nt10.99□□□□□ -0.65
NUS1Q12063 YLR179CYLR179C 606 nt10.99□□□□□ -0.65
NUS1Q12063 ATF2YGR177C 1608 nt10.98□□□□□ -0.65
NUS1Q12063 TRM5YHR070W 1500 nt10.97□□□□□ -0.65
NUS1Q12063 ADO1YJR105W 1023 nt10.94□□□□□ -0.66
NUS1Q12063 AQY1YPR192W 918 nt10.94□□□□□ -0.66
NUS1Q12063 YFL067WYFL067W 528 nt10.93□□□□□ -0.66
NUS1Q12063 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
NUS1Q12063 WSC2YNL283C 1512 nt10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms