Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab42Q0PD08 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab42Q0PD08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab42Q0PD08 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab42Q0PD08 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab42Q0PD08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab42Q0PD08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab42Q0PD08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab42Q0PD08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab42Q0PD08 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab42Q0PD08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab42Q0PD08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab42Q0PD08 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab42Q0PD08 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab42Q0PD08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab42Q0PD08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab42Q0PD08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab42Q0PD08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab42Q0PD08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab42Q0PD08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab42Q0PD08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab42Q0PD08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab42Q0PD08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab42Q0PD08 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab42Q0PD08 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab42Q0PD08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab42Q0PD08 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab42Q0PD08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab42Q0PD08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab42Q0PD08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab42Q0PD08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab42Q0PD08 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab42Q0PD08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab42Q0PD08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab42Q0PD08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab42Q0PD08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab42Q0PD08 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab42Q0PD08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab42Q0PD08 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab42Q0PD08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab42Q0PD08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab42Q0PD08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab42Q0PD08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab42Q0PD08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab42Q0PD08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab42Q0PD08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab42Q0PD08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms